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一种基因测序数据排序方法、集成电路及排序设备 

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摘要:本发明公开一种基因测序数据排序方法、集成电路及排序设备,属于计算机系统结构设计和数据排序技术领域,提出以下方案:一种基因测序数据排序方法,包括:读取待测序数据所需的存储容量,以判断待测序数据的大小;若待测序数据的大小不超过预设阈值,则将待测序数据在内部存储器排序,若待测序数据的大小超过预设阈值,则将待测序数据在内部存储器和外部存储器分级排序;在对待测序数据排序后,将待测序数据的排序结果写回外部存储器进行存储;本发明提升了基因测序数据排序的性能。

主权项:1.一种基因测序数据排序方法,其特征在于,包括:读取待测序数据所需的存储容量,以判断所述待测序数据的大小;若所述待测序数据的大小不超过预设阈值,则将所述待测序数据在内部存储器排序,若所述待测序数据的大小超过预设阈值,则将所述待测序数据在内部存储器和外部存储器排序;在对所述待测序数据排序后,将待测序数据的排序结果写回外部存储器进行存储;所述在内部存储器排序的步骤包括:采用快速排序算法将所述待测序数据在内部存储器进行排序;所述在内部存储器和外部存储器排序为,将待测序数据使用内部存储器和外部存储器之间交互的硬件排序网络来完成数据排序;若所述待测序数据的大小超过预设阈值,则将所述待测序数据在内部存储器和外部存储器进行排序的步骤包括:将所述待测序数据均等分割成多个小块基因测序数据。

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百度查询: 中科计算技术西部研究院 一种基因测序数据排序方法、集成电路及排序设备

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