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申请/专利权人:中国科学院分子细胞科学卓越创新中心;王连堂
摘要:本申请提供数字化细胞发育轨迹追踪方法、系统、设备及介质,包括:获取转录组数据,并对不同测序批次的转录组数据进行整合并矫正批次效应;通过选取高变异基因和或通过主成分分析法对细胞状态进行分类以提取发育基因集;基于所述发育基因集生成细胞发育谱系,据以追踪单个细胞和或细胞群体的发育轨迹。本发明提供了一种提高数字化细胞发育轨迹追踪效率的方法,本发明提供数字谱系追踪模型,通过连续计算相邻时间点的细胞或细胞群体间的“转录组距离”,来确定单个细胞或细胞群体在下一个时间点对应的发育子代,极大地提高了细胞发育谱系预测的精准度。
主权项:1.一种数字化细胞发育轨迹追踪方法,其特征在于,包括:获取转录组数据,并对不同测序批次的转录组数据进行整合并矫正批次效应;通过选取高变异基因和或通过主成分分析法对细胞状态进行分类以提取发育基因集;基于所述发育基因集生成细胞发育谱系,据以追踪单个细胞和或细胞群体的发育轨迹。
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百度查询: 中国科学院分子细胞科学卓越创新中心 王连堂 数字化细胞发育轨迹追踪方法、系统、设备及介质
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