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申请/专利权人：四川大学华西医院
申请日：2024-02-02
公开（公告）日：2024-06-18
公开（公告）号：CN118207291A
主分类号：C12Q1/6806
分类号：C12Q1/6806;C40B50/06
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.07.05#实质审查的生效;2024.06.18#公开
摘要：本发明涉及分子生物学技术领域，具体公开了极微量食管鳞癌组织ATAC‑seq测序文库的构建方法，先利用消化组织制备细胞悬浮液，再从细胞悬浮液中提取细胞核，将提取的细胞核进行转座和纯化，以获得纯化物，然后再将纯化物进行PCR富集，构建文库并进行片段筛选，最后对筛选后片段进行文库质检，获得测序文库，通过此方式可以从极微量的食管鳞癌组织中提取出目标DNA或RNA，通过纯化和富集的步骤来增加目标DNA或RNA的浓度，使其达到检测的限量，并进行筛选和质检，从而解决对于极微量组织样本的限制，使其能够解决对极微量（≤5mg）食管鳞癌组织并不适用的问题。
主权项：1.极微量食管鳞癌组织ATAC-seq测序文库的构建方法，其特征在于：包括如下步骤：S1、利用消化组织制备细胞悬浮液，再从细胞悬浮液中提取细胞核；细胞悬浮液在制备时，将新鲜食管鳞癌组织先放入dissociationbuffer中振荡；再加入washmedium离心；然后加冰StockCollagenaseTypeIISolution和冰StockDispaseSolution进行重悬、振荡，再使用注射器吹打10-12次重悬，最后再将悬液加入过滤器过滤，检测滤液活细胞率和成团率；S2、将提取的细胞核进行转座和纯化，以获得纯化物；S3、将纯化物进行PCR富集，构建文库并进行片段筛选；S4、对筛选后片段进行文库质检，获得测序文库。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 四川大学华西医院 极微量食管鳞癌组织ATAC-seq测序文库的构建方法
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