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基于ATAC测序数据筛选子宫内膜癌关键基因的方法及应用 

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申请/专利权人:哈尔滨医科大学附属第一医院;中国人民解放军军事科学院军事医学研究院

摘要:本发明涉及基因筛选技术领域,涉及基于ATAC测序数据筛选子宫内膜癌关键基因的方法及应用。本发明提供的基于ATAC测序数据的肿瘤关键基因的筛选方法包括,首先选取两个以上的指标将ATAC测序所得的峰位进行排序;然后将不同指标的峰位排序结果按照峰位数量均分成组,选择至少一组作为疑似包含肿瘤关键基因的初筛峰位分组;再筛选出初筛峰位分组中共同含有的峰位构成次筛峰位分组;最后根据目的肿瘤的基因表达值,对得到的次筛峰位分组中各峰位对应的基因进行最终筛选,得到肿瘤关键基因。该方法基于ATAC测序数据,通过选取多个判断指标对目的肿瘤的关键基因进行筛选,可以避免数据处理过程中人为因素的干扰,具有更高的可靠性。

主权项:1.基于ATAC测序数据筛选子宫内膜癌关键基因的方法,其特征在于,所述方法包括,首先选取两个以上的指标将ATAC测序所得的峰位进行排序;然后将不同指标的峰位排序结果按照峰位数量均分成组,选择至少一组作为疑似包含子宫内膜癌关键基因的初筛峰位分组;再筛选出不同指标得到的初筛峰位分组中共同含有的峰位构成次筛峰位分组;最后根据子宫内膜癌的基因表达值,对得到的次筛峰位分组中各峰位对应的基因进行最终筛选,得到子宫内膜癌关键基因;所述指标包括转录因子数目、染色质开放信号强度、peaks的大小或peak在基因组上的位置中的两种以上组合;所述子宫内膜癌的基因表达值包括子宫内膜癌的基因表达量和或子宫内膜癌的基因差异表达量。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 哈尔滨医科大学附属第一医院 中国人民解放军军事科学院军事医学研究院 基于ATAC测序数据筛选子宫内膜癌关键基因的方法及应用

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