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空间组学生物组织切片图像与RNA-seq热图的配准方法、产品、设备及介质 

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申请/专利权人:深圳赛陆医疗科技有限公司

摘要:本申请提供一种空间组学生物组织切片图像与RNA‑seq热图的配准方法、产品、设备及介质,所述方法包括:获取初始的组织切片图像和RNA‑seq热图;对组织切片图像和RNA‑seq热图基于各自图像中组织成像区域和组织重心位置进行初配准;以初配准后的RNA‑seq热图为固定图像、组织切片图像为浮动图像,对浮动图像按照预设规则进行尺度变换得到多尺度浮动图像,针对每一尺度浮动图像,进行刚性变换和或弹性变形后,采用梯度下降法对度量浮动图像与固定图像之间相似性的目标函数进行优化以执行迭代计算,根据迭代终止条件从所述多尺度浮动图像中确定目标浮动图像;将目标浮动图像对应的组织切片图像与作为固定图像的RNA‑seq热图进行配准,可避免引入干扰、可靠且经济高效地实现配准。

主权项:1.一种空间组学生物组织切片图像与RNA-seq热图的配准方法,其特征在于,包括:获取初始的组织切片图像和RNA-seq热图;对所述组织切片图像和所述RNA-seq热图基于各自图像中组织成像区域和组织重心位置进行初配准;以初配准后的所述RNA-seq热图为固定图像、所述组织切片图像为浮动图像,对所述浮动图像按照预设规则进行尺度变换,得到一组包含多尺度浮动图像的第一图像金字塔;基于所述第一图像金字塔进行搜索选定,针对选定的每一尺度浮动图像,通过刚性变换参数矩阵对当前浮动图像进行刚性变换,以度量浮动图像与固定图像之间相似性的目标函数采用梯度下降法进行迭代计算,以对所述刚性变换参数矩阵进行迭代更新,根据迭代终止条件从所述第一图像金字塔中确定优选浮动图像;对所述优选浮动图像按照预设规则进行尺寸变换,得到另一组包含多尺度浮动图像的第二图像金字塔;基于所述第二图像金字塔进行搜索,针对每一尺度浮动图像,通过B样条曲面的控制点参数对当前浮动图像进行弹性变形,以度量浮动图像与固定图像之间相似性的目标函数采用梯度下降法进行迭代计算,以对所述B样条曲面的控制点参数进行迭代更新,根据迭代终止条件确定目标浮动图像;将所述目标浮动图像对应的组织切片图像与作为所述固定图像的所述RNA-seq热图进行配准。

全文数据:

权利要求:

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