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申请/专利权人：中国科学院大连化学物理研究所
摘要：本发明公开了一种肠道菌群相关代谢物数据库的高覆盖构建方法。首先通过文献检索收集文献已报道的肠道菌群相关代谢物，并通过其PubChemCID对代谢物去重，建立基于先验知识的肠道菌群相关代谢物库。其次对该库进行扩充：采用性别、年龄均匹配的无菌抗生素处理无特定病原体小鼠，对其血浆、尿液、粪便进行非靶向代谢组学分析，结合统计学方法限定出未涵盖在知识库的新型肠道菌群代谢物；本发明方法结合了知识导向的和生物样本中实测的肠道菌群相关代谢物，为菌群代谢物数据库的高覆盖构建提供了思路，也为代谢组学数据中肠道菌群相关代谢物的大规模注释和菌群‑宿主相互作用的分子机制研究奠定了基础。
主权项：1.一种肠道菌群相关代谢物数据库的高覆盖构建方法，其特征在于：1在ISIWebofScience和PubMed中进行文献检索，收集文献已报道的实测得的而非预测的、宿主限定为人类和小鼠的肠道菌群相关代谢物，并通过人工核查PubChemCID对代谢物去重，建立基于先验知识的肠道菌群相关代谢物数据库；2对步骤1建立的肠道菌群相关代谢物数据库进行扩展，通过无菌小鼠、抗生素处理小鼠和无特定病原体小鼠模型从实际生物样本中限定出未被文献报道的新型肠道菌群相关代谢物，并将其添加到上述知识导向的肠道菌群相关代谢物数据库中，获得高覆盖的肠道菌群相关代谢物数据库。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院大连化学物理研究所 一种肠道菌群相关代谢物数据库的高覆盖构建方法
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