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申请/专利权人：苏州腾迈医药科技有限公司
摘要：本公开涉及一种分子力场拟合方法及装置，该方法包括：根据各目标分子的3D结构对各目标分子进行碎片化处理，确定出各目标分子的碎片，目标分子为用于与受体蛋白结合的配体分子；生成碎片集合并确定出碎片集合中各碎片与各目标分子之间的对应关系；对各目标分子和碎片进行几何优化，确定出各目标分子的最稳定构象；对各目标分子的最稳定构象对该目标分子的各碎片分别进行静电势或单点能量计算，得到各碎片的对应的计算结果；计算出各目标分子的电荷信息；根据各碎片对应的计算结果和目标分子的电荷信息，计算出不同二面角角度下各碎片的总能量，最后拟合出每个目标分子的力场参数，分子力场拟合的精度高、准确性好，且拟合速度快。
主权项：1.一种分子力场拟合方法，其特征在于，所述方法包括：根据各目标分子的3D结构对各所述目标分子进行碎片化处理，确定出各所述目标分子的碎片，所述目标分子为用于与受体蛋白结合的配体分子；根据各所述目标分子的碎片生成碎片集合，并确定出所述碎片集合中各碎片与各目标分子之间的对应关系；对各所述目标分子进行几何优化，确定出各所述目标分子的最稳定构象；根据各所述目标分子的最稳定构象对该目标分子的各碎片分别进行静电势或单点能量计算，得到各所述目标分子中各碎片的对应的计算结果；根据各所述计算结果拟合出各所述目标分子的电荷信息；根据各所述目标分子的碎片对应的计算结果和该目标分子的电荷信息，计算出不同二面角角度下所述目标分子的各碎片的总能量，并基于所述总能量拟合出每个碎片所有二面角的力场参数；综合每个目标分子中各碎片对应的力场参数，输出所有目标分子的格式化力场参数文件；其中，对各所述目标分子进行几何优化，确定出各所述目标分子的最稳定构象，包括：根据各所述目标分子的初始分子坐标，采用密度泛函方法对各所述目标分子的几何结构进行优化，得到优化后分子坐标；根据各所述目标分子对应的优化后分子坐标，确定出各目标分子的最稳定构象。
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百度查询： 苏州腾迈医药科技有限公司 分子力场拟合方法及装置
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