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一种基于反应物浓度调控的DNA逻辑门功能转换方法 

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摘要:本发明公开一种基于反应物浓度调控的DNA逻辑门功能转换方法,涉及DNA逻辑运算领域,尤其涉及逻辑功能转换技术,具体为通过输入浓度调控逻辑门的功能转换。该方法在底物中加入一段转换域,这段转换域不仅能作为区分不同输入与底物反应的标志,同时也是使不同输入与底物结合能力产生差异的功能域。本发明以此为基础构建了或门,并且设计实现了以转换域为核心,通过不同输入浓度调控逻辑门在或门、异或门和非激活态逻辑门无论任何浓度的输入均无输出产出的逻辑门之间的状态转换。利用该方法,可广泛应用于构建DNA分支电路、生物传感器以及纳米技术。

主权项:1.一种基于反应物浓度调控的DNA逻辑门功能转换方法,其特征在于,所述方法包括:构建DNA三链复合物[A,B,C];以所述DNA三链复合物[A,B,C]作为DNA逻辑门底物;通过不同输入浓度调控所述DNA逻辑门底物,实现DNA逻辑门功能转换;其中,构建DNA三链复合物[A,B,C],包括:步骤1:设计由转换域t1、t2和结构域a、b共同组成输入结合臂的三链结构,DNA片段c、d、e、f、g、h、i、m、n也共同组成DNA三链结构;其中,结构域a、b作为逻辑门两条输入链的输入结合臂,而转换域t1、t2只能分别作用于其中的一条输入链;步骤2:设计作为输入的A链和作为输出的B链和C链,A链包括能够与自己产生互补的结构域e和e*,中间由c、g和c*构成的单链DNA存在相互互补的结构域c和c*;B链包括能够与A链产生互补的结构域f*、e*;C链包括能够与A链产生互补的结构域e、h*;A链上还包括不相互互补的结构域f和h,但是f和h结构域能够与B链和C链互补;步骤3:根据步骤2中的B链和C链,设计悬垂的结构域m、n、d和d域的互补域d*,d和d*作为辅助输入与底物反应的结构域;其中f、h、m和n四个结构域与其他底物的输入结合臂互补;步骤4:得到三链底物中的A链、B链和C链,根据A链的互补,得到两个输入链L和R;将A链、B链和C链退火,得到目标DNA三链复合物[A,B,C]。

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百度查询: 沈阳航空航天大学 一种基于反应物浓度调控的DNA逻辑门功能转换方法

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