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申请/专利权人：圣湘生物科技股份有限公司;长沙圣维数智生物科技有限公司;圣湘(上海)基因科技有限公司

摘要：本发明属于细菌感染检测领域，具体地，涉及一种细菌宏基因组测序数据的疑似细菌判定分析方法、装置及其应用。本发明提供了一种细菌宏基因组测序数据的分析方法，包括如下步骤：S1、获取细菌宏基因组测序数据；S2、将所述测序数据按照物种进行匹配，并按照物种获取细菌物种reads数集；S3、对所述细菌物种reads数集的细菌reads序列进行特异性鉴定，获取细菌物种特异性和非特异性reads序列集；S4、根据如下公式获取细菌物种reads数集的GA‑ratio值、MS‑ratio值、G‑dps值，以及Cro‑S值；S5、根据上述GA‑ratio值、MS‑ratio值、G‑dps值，以及Cro‑S值按照如下任一判断标准过滤假阳性结果，并输出最终结果。

主权项：1.一种细菌宏基因组测序数据的分析方法，包括如下步骤：S1、获取细菌宏基因组测序数据；S2、将所述测序数据按照物种进行匹配，并按照物种获取细菌物种reads数集；S3、对所述细菌物种reads数集的细菌reads序列进行特异性鉴定，获取细菌物种特异性和非特异性reads序列集；S4、根据如下公式获取细菌物种reads数集的GA-ratio值、MS-ratio值、G-dps值，以及Cro-S值：GA-ratio值＝单个物种的特异性reads数同属中最高特异性reads数；MS-ratio值＝单个物种非特异性reads数单个物种特异性reads数；G-dps值＝同一物种比对起始位点集合的平均差同一物种比对起始位点集合的平均值；Cro-S值＝跨域比对reads数跨域比对reads数+非跨域比对reads数；S5、根据上述GA-ratio值、MS-ratio值、G-dps值，以及Cro-S值按照如下任一判断标准过滤假阳性结果，并输出最终结果：GA-ratio值≤0.085，MS-ratio值≥20，G-dps值≤0.085，或者Cro-S值≥0.6。

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