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申请/专利权人：赛纳生物科技(北京)有限公司
摘要：本发明提供一种基因测序信号去除串扰的方法。利用孤立数据点进行测算，最终获取复杂环境下的真实测序信号。该方法适用于3端不封闭的测序方法。串扰的方法包含，1测序获得测序结果图像；2获取测序微坑的信号强度；3设定信号强度阈值；4筛选出孤立亮坑；5估算串扰6应用串扰平均值获得校正的测序信号强度值。
主权项：1.一种基因测序信号去除串扰的方法，其特征在于包含，1利用基因测序芯片对待测基因序列进行测序反应，获得测序结果图像；2通过测序结果图像获取基因测序芯片上微坑的信号强度；3设定信号强度阈值，高于阈值的信号对应的微坑发生测序反应，低于阈值的信号对应的微坑未发生测序反应；定义发生测序反应的微坑为亮坑，定义未发生测序反应的微坑为暗坑；4筛选出孤立暗坑，通过孤立暗坑的信号强度获取背景信号平均值；5筛选出孤立亮坑；6通过孤立亮坑估算亮坑向周围相邻微坑的串扰,并取得串扰平均值；7应用串扰平均值和背景信号平均值去卷积获得校正的测序信号强度值；其中，所述的孤立亮坑，指的是该亮坑的直接相邻的周围微坑均为暗坑；所述孤立暗坑，指的是该暗坑周围两层微坑的范围内，都没有亮的微坑；其中，步骤1中所述的测序反应指的是3端不封闭的二代基因测序方法；其中，与孤立亮坑直接相邻的微坑称为一级串扰微坑，与孤立亮坑隔一个微坑，并且与一级串扰微坑相邻的微坑称为二级串扰微坑；步骤5筛选孤立亮坑的时候，选择一级串扰微坑与二级串扰微坑都没有发生反应的孤立亮坑；步骤6中所述串扰平均值包括一级串扰微坑的串扰平均值，也包括二级串扰微坑的串扰平均值；步骤2中所述信号强度为每个微坑在图像中所反应的实际像素的平均值。
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权利要求：
百度查询： 赛纳生物科技(北京)有限公司 一种基因测序信号去除串扰的方法
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