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申请/专利权人:东南大学
摘要:本发明提出了一种基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法,采用全分隔或半分隔反应体系的方法,提高嵌合序列组成片段间的同源性。利用具有链置换能力的核酸聚合酶介导的多重链置换扩增过程中产生扩增产物,将扩增产物的测序结果与参考基因组比对,获得组成片段高度同源的嵌合序列,利用嵌合序列的组成片段间的基因连锁关系,本发明嵌合序列的组成片段具有高度同源性,且组成片段之间的座落距离可提供更多的长距离连锁关系。基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法,只使用具有链置换能力的DNA聚合酶介导的多重链置换扩增后的测序数据来进行全基因组单倍型组装,在经济效益和组装效果上,可以达到很好的平衡。
主权项:1.一种基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法,其特征在于,通过采用全分隔或半分隔反应体系的方法对基因组进行多重链置换扩增反应得到扩增产物,将扩增产物的测序结果与参考基因组比对,获得组成片段高度同源的嵌合序列,利用高度同源的嵌合序列的组成片段间的基因连锁关系,进行基因组单倍型组装。
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百度查询: 东南大学 一种基于嵌合序列的全基因组单倍型组装方法
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