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一种用于检测剪接异构体的靶向高通量测序方法 

申请/专利权人:上海茵创昕生物科技有限公司

申请日:2024-02-20

公开(公告)日:2024-07-05

公开(公告)号:CN118302538A

主分类号:C12Q1/6806

分类号:C12Q1/6806

优先权:["20230427 CN PCT/CN2023/091367"]

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.07.23#实质审查的生效;2024.07.05#公开

摘要:一种用于检测剪接异构体的靶向高通量测序方法,包括用于高通量测序的测序文库的建立方法,包括以下步骤:1采用逆转录引物对样本RNA进行逆转录,加入普通dNTP和3’修饰的dNTP,反应得到cDNA第一链;2通过点击化学反应将5’端带有炔基修饰的寡核苷酸片段与步骤1获得的cDNA片段连接;3以步骤2的反应产物为模板,PCR扩增;4获得测序文库。靶向富集引物可在逆转录或PCR扩增步骤中引入。富集步骤反应体系中含有多个基因特异性引物,且每个引物基于该转录本中选择性剪接事件的下游外显子区段设计,保证逆转录产生的随机长度片段覆盖剪接位点。

主权项:1.一种用于高通量测序的测序文库的建立方法,其包括以下步骤:1采用逆转录引物对样本RNA进行逆转录,加入普通dNTP和3’修饰的dNTP,反应得到cDNA第一链,所述3’修饰的dNTP选自以下的一种或多种:AzNTP、AmNTP、propargyl-NTP、HalNTP;2通过点击化学反应将5’端带有炔基修饰的寡核苷酸片段与步骤1获得的cDNA片段连接,所述寡核苷酸片段包含随机序列和通用测序引物1seq1的互补区段序列;3以步骤2的反应产物为模板,进行PCR反应扩增;4获得测序文库。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 上海茵创昕生物科技有限公司 一种用于检测剪接异构体的靶向高通量测序方法

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