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一种基因编辑系统脱靶的检测方法 

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申请/专利权人:中国医学科学院血液病医院(中国医学科学院血液学研究所)

摘要:本公开涉及一种基因编辑系统脱靶的检测方法OliTag‑seq,所述检测方法包括:使双链寡聚脱氧核苷酸dsODN整合到细胞基因组DNA的双链断裂位置,扩增包含整合的dsODN的基因组DNA的部分,对所述扩增的基因组DNA的部分进行测序,从而检测所述细胞的基因组DNA中的双链断裂;其中,所述双链寡聚脱氧核苷酸dsODN的长度为35bp~200bp,在所述dsODN的3’末端和5’末端各包含1~3个GCDNA对。本公开方法能够有效识别基因编辑系统诱导产生的脱靶位点,与现有方法相比,对脱靶位点识别表现出更高的灵敏性,在疾病诊断与风险评估、临床研究与药物开发、转基因生物技术等领域有着广泛的应用前景。

主权项:1.一种基因编辑系统脱靶的检测方法OliTag-seq,其特征在于,所述检测方法包括:使双链寡聚脱氧核苷酸dsODN整合到细胞基因组DNA的双链断裂位置,扩增包含整合的dsODN的基因组DNA的部分,对所述扩增的基因组DNA的部分进行测序,从而检测所述细胞的基因组DNA中的双链断裂;其中,所述双链寡聚脱氧核苷酸dsODN的长度为35bp~200bp,在所述dsODN的3’末端和5’末端各包含1~3个GCDNA对;优选地,所述双链寡聚脱氧核苷酸dsODN的长度为39bp。

全文数据:

权利要求:

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