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摘要:本发明公开了桑树全基因组液相芯片,液相芯片的基因分型位点包括定位在桑树参考基因组Morus_alba_ASM1206604v3上的共计45668个SNP位点。桑树全基因组液相芯片,从大规模测序数据中筛选出可用于芯片设计的45668个SNP位点,其位点来源涵盖国内更多的桑树品种,通用性更强;本发明的桑树全基因组芯片适用于靶向捕获测序技术,通过相应的探针设计,不仅可以对探针靶点进行分型,同时可以对探针靶点周围扩增区域进行分型,因此与具有相同数目探针的固相芯片相比,可以检测出更多的变异位点,同时在提高检测位点数目的基础上明显降低分型成本。
主权项:1.桑树全基因组液相芯片,其特征在于,液相芯片的基因分型位点包括定位在桑树参考基因组Morus_alba_ASM1206604v3上的共计45668个SNP位点,45668个所述SNP位点缺失率不大于10%、杂合率不大于50%、最小等位变异频率不小于0.3。
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百度查询: 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所 江苏科技大学 桑树全基因组液相芯片及其应用
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