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基于生物信息学分析miR-106a-363簇的共同靶标的方法 

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摘要:本发明涉及生物信息学领域,公开了基于生物信息学分析miR‑106a‑363簇的共同靶标的方法,包括以下步骤:miR‑106‑363簇与结核病相关性分析;miR‑106‑363簇中结核病相关成员的靶基因和通路分析;验证miR‑106‑363簇中成员在结核感染中与关键靶基因间的相互作用。本发明采用上述的方法,预测miR‑106a‑363簇的共同靶标,通过文献分析结合预测结果定位该miRNA簇影响结核免疫的潜在关键靶标,并验证牛miR‑106a‑363簇与靶标基因之间的调控关系,揭示了其在奶牛结核免疫中发挥的潜在作用,为进一步研究结核病及抗结核基因编辑育种靶点挖掘提供新的理论基础和研究思路。

主权项:1.基于生物信息学分析miR-106a-363簇的共同靶标的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤1,miR-106-363簇与结核病相关性分析,查阅数据库中与结核病相关的miRNA以及mRNA测序数据,分析其中miR-106-363簇主要成员的表达变化趋势,以及其与结核相关调控过程中的关键基因和结核表型之间的相关性;步骤2,miR-106-363簇中结核病相关成员的靶基因和通路分析,通过相关软件预测并筛选miR-106-363簇结核相关成员的靶基因,用于GO和KEGG分析绘制其参与的主要通路,并筛选出簇中miRNA参与调控的关键基因;步骤3,验证miR-106-363簇中成员在结核感染中与关键靶基因间的相互作用,通过分子生物学技术确认miR-106-363簇中结核相关成员和靶基因间的相互作用关系,并通过攻菌实验,验证受簇中microRNA调节的靶基因是否能影响结核分枝杆菌感染进程。

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