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一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法 

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申请/专利权人:安徽大学

摘要:本发明公开了一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其中方法包括:从公开数据库中,收集噬菌体多肽数据、收集抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;对抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据进行冗余序列去除后,分别与噬菌体多肽数据进行同源性分析,并进行预处理后,获取噬菌体特异性的抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;构建正样本数据集和负样本数据集;数据应用包括:训练神经网络,进行神经网络应用,获取噬菌体特异性抗细菌肽或非抗细菌肽数据正负样本分类预测。本发明方法有效的对噬菌体和抗细菌肽之间的协同作用进行探索,实现噬菌体特异性抗细菌肽非噬菌体特异性抗细菌肽准确的目标分类,为后续噬菌体的工程改良及潜在高效抗细菌肽的发掘做出贡献。

主权项:1.一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法,其特征在于,包括:S1、从公开数据库中,收集噬菌体多肽数据;S2、从公开数据库中,收集抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;S3、对抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据进行冗余序列去除后,分别与噬菌体多肽数据进行同源性分析,并进行预处理后,获取噬菌体特异性的抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据;S4、利用噬菌体特异性的抗细菌肽数据和非抗细菌肽数据,构建正样本数据集和负样本数据集;S5、依据正样本数据集和负样本数据集训练神经网络,进行神经网络应用,获取噬菌体特异性抗细菌肽或非抗细菌肽数据正负样本分类预测。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 安徽大学 一种噬菌体特异性的抗细菌肽数据处理应用方法

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