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申请/专利权人：中国科学院武汉植物园
摘要：本发明公开基于非参数检验的差异基因识别方法，获取实验组和对照组的基因表达矩阵；计算基因在实验组中的基因表达水平序列和在对照组中的基因表达水平序列之间的MMD无偏经验估计作为基因的原始MMD无偏经验估计；将基因在实验组中的基因表达水平序列和在对照组中的基因表达水平序列中的基因表达水平合并再随机打乱重排后，计算MMD无偏经验估计作为新的MMD无偏经验估计，计算基因的显著性参数，根据显著性参数判断差异表达基因。本发明本方法不依赖特定的数据分布假设，能够更灵活地处理时间点稀少或者基因表达水平波动大的数据集。适用于各种类型的基因表达数据，提高分析的灵活性和适用性。
主权项：1.基于非参数检验的差异基因识别方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：获取实验组和对照组的基因表达矩阵，基因表达矩阵的每一列代表一个时间点，基因表达矩阵的每一行的各个元素构成行对应的基因的基因表达水平序列；步骤2：计算基因i在实验组中的基因表达水平序列和在对照组中的基因表达水平序列之间的MMD无偏经验估计，作为基因i的原始MMD无偏经验估计；步骤3：将基因i在实验组中的基因表达水平序列和在对照组中的基因表达水平序列中的基因表达水平合并再随机打乱重排后，生成基因i在实验组中的新的基因表达水平序列和在对照组中的新的基因表达水平序列并计算MMD无偏经验估计作为新的MMD无偏经验估计，根据原始MMD无偏经验估计和新的MMD无偏经验估计计算基因i的显著性参数Padj，若基因i的显著性参数Padj小于显著性阈值，则认为基因i为差异表达基因。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院武汉植物园 基于非参数检验的差异基因识别方法
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