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申请/专利权人:东北电力大学
摘要:本发明涉及生物信息学中的药物交互预测领域,尤其涉及一种基于多源药物特征的药物交互智能预测系统及其方法,该系统包括:药物信息采集与预处理模块,用于采集药物信息并进行预处理;药物特征匹配模块,基于相似度计算,将药物特征矩阵转化为相似度矩阵;药物特征信息增强模块,基于距离计算,从药物的最近邻居中学习药物之间局部结构相似性,构建相似度矩阵;药物交互预测模块,构建预测模型从药物的相似度矩阵中学习,实现药物交互预测,输出潜在的药物交互列表;本发明结构合理,性能强,预测准确率高,适用范围广。
主权项:1.一种基于多源药物特征的药物交互智能预测系统,其特征在于,包括:药物信息采集与预处理模块,用于从药物数据库中采集药物信息,分别构建包含通路、酶、靶标、化学亚结构四种特征信息的数据集X和包含药物交互信息的数据集Y,由X中四种特征信息构建四个特征矩阵,由Y中的药物交互信息构建药物交互观测矩阵;药物特征匹配模块,用于计算X的四种特征下,每两种药物之间的相似度,从而将四个特征矩阵转化为四个相似度矩阵,利用相似度矩阵确定药物之间的匹配关系,并对相似度矩阵进行迭代归一化处理;药物结构信息增强模块,基于距离计算寻找每种药物的最近邻居,再根据X中所有药物的最近邻居信息迭代更新其相似度矩阵,使其从最近邻居中学习药物之间的局部结构相似性,以增强药物相似度矩阵中所能表达的结构信息,并对相似度矩阵进行迭代归一化处理;药物交互预测模块,输入药物的相似度矩阵训练模型,获得每种特征的权重矩阵,累加四种特征矩阵与其对应的权重矩阵的乘积,得到药物交互预测矩阵,将其与药物交互观测矩阵作差,值为1的位置表示存在潜在的药物交互,输出潜在的药物交互列表。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 东北电力大学 基于多源药物特征的药物交互智能预测系统及其方法
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