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申请/专利权人:奥明星程(杭州)生物科技有限公司
摘要:本发明提供一种cfDNAjagged序列文库制备连接方法,通过先对双链cfDNA进行加热变性成单链DNA,再对cfDNA单链直接进行5'端接头连接、3'端接头连接,之后对纯化后的3'接头连接产物进行PCR扩增,最后进行常规测序。本发明方法针对单链cfDNA设计了全新的非对称接头,P5接头为单链,进行了3端磷酸化;P7接头为非对称双链,进行了5端磷酸化,从而最大限度减少接头二聚体的产生;而且本发明方法中,P5接头连接后无需延伸和纯化,直接进行P7接头连接,不仅节省了磁珠的使用,而且避免了连接产物的损失和浪费。
主权项:1.一种cfDNAjagged序列文库制备连接方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)对双链cfDNA进行加热变性成为单链DNA;(2)对步骤(1)所得单链DNA进行5'端接头连接;其中,所述5'端接头的序列具体为:5'-AATCGGCCATTGCCATTGCAAT-P-3;(3)对步骤(2)所得连接产物进行3'端接头连接;其中,所述3'端接头的序列具体为:5’-p-AGTTAACCGCGCGTACTCCGATCGGC-3’3’-ATGCAGTCAATTGGCGCGCATGAGGCTAGCCG-5’;(4)对纯化后的3'接头连接产物进行PCR扩增;(5)文库质检,合格后进行混样和送测序。
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