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一种基于纳米孔靶向测序技术检测SDC2基因启动子甲基化的方法及检测试剂盒 

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申请/专利权人:厦门大学

摘要:一种基于纳米孔靶向测序技术检测SDC2基因启动子甲基化的方法及检测试剂盒,属于分子医学技术领域。通过将纳米孔长读长测序技术和Cas9体外切割技术进行结合来检测SDC2基因启动子甲基化位点的甲基化状态,针对SDC2启动子区域设计四条Cas9靶向切割SDC2基因启动子的crRNA间隔序列,在目标区域上下游各切割两次,包含SDC2启动子区域及其侧翼区域。本方法检测甲基化位点不需要经过重亚硫酸盐处理样本,可以快速高效的获得样本DNA最原始的甲基化状态,既可以从整体水平评估甲基化水平还可以获得单个甲基化位点的甲基化状态,可为结直肠癌和肠进展性腺瘤诊断提供参考。

主权项:1.一组靶向SDC2基因启动子的crRNA间隔序列,其特征在于其核苷酸序列如序列表SEQIDNo.1~No.4所示,具体如下:SEQIDNo.1:GUAAUAAGAGUAGUCCCAGC;SEQIDNo.2:AGCGAUGGCUCAUUAAUGGU;SEQIDNo.3:UACACCGAGAGAUAAUGCAU;SEQIDNo.4:GCCGCUUAUAAAUCCAGCAG。

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百度查询: 厦门大学 一种基于纳米孔靶向测序技术检测SDC2基因启动子甲基化的方法及检测试剂盒

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