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基于CT切片注意力Transformer的胃肠道间质瘤风险等级预测方法 

申请/专利权人:天津工业大学

申请日:2024-03-29

公开(公告)日:2024-06-14

公开(公告)号:CN118197627A

主分类号:G16H50/30

分类号:G16H50/30;G16H50/70;G16H50/20;G16H10/40;G16H30/20;G06V10/764;G06V10/82;G06V10/44;G06V10/80;G06N3/0455

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.07.12#实质审查的生效;2024.06.14#公开

摘要:本发明提供了一种基于CT切片注意力Transformer的胃肠道间质瘤风险等级预测方法,可以自动整合CT图像的序列信息和临床信息对患者胃肠道间质瘤进行危险度分级。首先使用切片间注意力机制来捕捉CT切片间的序列关系,然后将切片间的注意力机制嵌入到Transformer中构成多头切片间注意力机制模块,简称IAT模块。将IAT模块应用到VisionTransformer网络中构成基于切片间序列关系注意力机制的特征提取网络提取CT图像特征,最后融合临床信息特征进行胃肠道间质瘤的危险度分级。与其他方案相比本发明具有良好的模型性能,可应用于辅助医生诊断的场景,具有较好的发展前景。

主权项:1.一种基于CT切片注意力Transformer的胃肠道间质瘤风险等级预测方法,包括下列步骤:步骤1:收集胃肠道间质瘤患者的CT图像以及临床信息作为原始数据集;步骤2:进行数据预处理,对CT图像进行分割ROI区域、数据均衡化、截取ROI区域和数据归一化处理;对临床信息数据进行数据清洗和数据归一化;步骤3:将Resnet作为编码器对患者每张CT图像提取特征,得到一个特征图的堆栈其中f是患者CT切片图像的张数,w是特征图的宽度,c是通道数,h是高度,将池化操作后的特征图堆栈经过线性映射得到模型中查询向量Q和键值K,α表示平均池化因子,正常编码后的特征图堆栈做线性变换得到值V,具体的计算公式为: V=xWV然后在四维空间中计算切片之间的注意力矩阵 其中,dα=hwcα2;切片序列间的注意力的输出计算公式为:y=AV;步骤4:将切片间的注意力机制嵌入到Transformer中构成多头切片间注意力机制模块,简称IAT;编码器的输出作为IAT模块的输入,并行执行多个注意力机制得到yi,i=1,2,...H,H是注意力头的数量,将c个维度所有yi合并操作得到y,再经过线性投影、激活函数和带有跳跃连接的层归一化得到IAT模块的输出: 步骤5:对每个提取到的深度特征图进行位置编码,加入一个可学习的位置编码PEi,对于每一切片,通道2j和通道2j+1上的所有元素位置编码为: 经过位置编码后的深度学习特征经过N个Transformer块,不同切片的特征映射相互作用于切片序列之间信息学习,最后将0位置编码的特征向量将其经过拉平操作成为一维特征向量z0;步骤6:对临床信息得到的一维特征向量与z0进行拼接操作,并以患者的序号作为索引,得到特征向量将其输入到改进的MLP线性映射层中,对患者进行胃肠道间质瘤的风险等级预测。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 天津工业大学 基于CT切片注意力Transformer的胃肠道间质瘤风险等级预测方法

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