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八碱基霍夫曼压缩轮转编码方法及装置 

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申请/专利权人:之江实验室;华中科技大学

摘要:本发明提供了一种八碱基霍夫曼压缩轮转编码方法及装置,涉及DNA数据存储技术领域。所述方法包括:通过霍夫曼压缩将原始数据压缩为六进制数据;基于六种碱基排列对所述六进制数据进行轮转编码,得到碱基序列。本发明,利用非天然碱基P、B、S、Z参与DNA序列的合成,并利用霍夫曼压缩处理数据可以增加DNA数据存储的存储密度,本发明实施例中,还提出对霍夫曼压缩处理得到的六进制数据进行轮转编码,避免碱基S连续出现、碱基Z连续出现以及碱基S和碱基Z连续出现,从而避免后续DNA测序过程中Hel308解旋酶的解离,造成测序结果错误。

主权项:1.一种八碱基霍夫曼压缩轮转编码方法,其特征在于,所述方法包括:通过霍夫曼压缩将原始数据压缩为六进制数据;基于六种碱基排列对所述六进制数据进行轮转编码,得到碱基序列;其中,所述六种碱基排列是基于轮转编码算法,在以八种碱基S、Z、P、B、A、T、C、G为前一位核苷酸,并避免碱基S连续出现、碱基Z连续出现以及碱基S和碱基Z连续出现的情况下,对所述八种碱基进行排列得到的。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 之江实验室 华中科技大学 八碱基霍夫曼压缩轮转编码方法及装置

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