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申请/专利权人：华南农业大学;清远市清城区清远鸡研究院;清远市清城区动物卫生防疫中心

摘要：本发明公开了与五黑鸡皮肤乌度相关的DCT基因分子标记及其应用，属于家禽育种领域。本发明通过研究发现DCT基因上存在9个SNP位点，其中SNP位点NC_052532.1:g143A＞G、NC_052532.1:g165G＞T、NC_052532.1:g227A＞G、NC_052532.1:g268C＞A和NC_052532.1:g344T＞C与翅根肱骨突起处皮肤乌度L1显著相关；NC_052532.1:g268C＞A和NC_052532.1:g344T＞C与龙骨突左侧皮肤乌度L2显著相关，以上SNP位点可作为五黑鸡皮肤乌度性状选育的潜在分子标记。

主权项：1.一种鉴别五黑鸡皮肤乌度的方法，其特征在于，包括以下步骤：1以待测鸡基因组DNA为模板，利用引物扩增分子标记或者包括分子标记的基因片段，获取扩增产物；所述引物为如SEQIDNO：2所示的上游引物和SEQIDNO：3所示的下游引物；2对所述扩增产物测序，检测所述分子标记的单核苷酸多态性位点SNP1-SNP5的基因型，根据检测的基因型判断待测鸡的皮肤乌度；所述分子标记的核苷酸序列如SEQIDNO：1所示，所述分子标记包括单核苷酸多态性位点SNP1-SNP5，其中，所述SNP1为SEQIDNO：1所示序列中存在的NC_052532.1:g.143AG，所述SNP2为SEQIDNO：1所示序列中存在的NC_052532.1:g.165GT，所述SNP3为SEQIDNO：1所示序列中存在的NC_052532.1:g.227AG，所述SNP4为SEQIDNO：1所示序列中存在的NC_052532.1:g.268CA，所述SNP5为SEQIDNO：1所示序列中存在的NC_052532.1:g.344TC；所述SNP1的基因型为AA、AG或GG；所述SNP2的基因型为GG、GT或TT；所述SNP3的基因型为AA、AG或GG；所述SNP4的基因型为CC、CA或AA；所述SNP5的基因型为TT、TC或CC；所述鸡的皮肤乌度为鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度和鸡的龙骨突左侧皮肤乌度；所述SNP1、所述SNP2、所述SNP3、所述SNP4和所述SNP5处基因型均与鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度显著相关；所述SNP4和所述SNP5处基因型均与鸡的龙骨突左侧皮肤乌度显著相关；在所述SNP1位点处，AA基因型和AG基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度高于GG基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度；在所述SNP2位点处，GG基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度高于GT基因型和TT基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度；在所述SNP3位点处，AA基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度高于GG基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度；在所述SNP4位点处，CC基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度和龙骨突左侧皮肤乌度均高于CA基因型和AA基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度和龙骨突左侧皮肤乌度；在所述SNP5位点处，TT基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度和龙骨突左侧皮肤乌度均高于TC基因型和CC基因型的鸡个体的鸡翅根部肱骨突起处皮肤乌度和龙骨突左侧皮肤乌度。

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百度查询： 华南农业大学 清远市清城区清远鸡研究院 清远市清城区动物卫生防疫中心 与五黑鸡皮肤乌度相关的DCT基因分子标记及其应用