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申请/专利权人:中国科学院计算技术研究所
摘要:本发明提出一种基于密铺的SpMV并行分块计算方法和系统,包括:根据稀疏矩阵转换为图G;对图G进行基于密铺图的划分,得到多个子图Gi,子图Gi中每个结点Vi沿时间维度更新,直到子图Gi中所有结点若再次更新无法满足结点Vi与边Ei的依赖关系为止,则子图Gi完成了子图最大更新,得到最终子图;根据最终子图中各节点的更新次数,为最终子图的数据行进行的计算行顺序进行重新排序;基于待SpMV的稠密向量,对重新排序后的最终子图进行矩阵分块计算,得到SpMV计算结果。本发明能够扩展SpMV多次迭代计算的分块维度,且不包含冗余计算,不改变SpMV核心计算循环,使得SpMV迭代计算能够高并发地执行。
主权项:1.一种基于密铺的SpMV并行分块计算方法,其特征在于,包括:步骤1、获取待SpMV的稀疏矩阵,根据该稀疏矩阵中非零元的位置,将该稀疏矩阵转换为图GV,E,图G的顶点代表了该稀疏矩阵的每行列,或该稀疏矩阵的网格格点;图G的边代表该稀疏矩阵的每行列中非零元位置,或者网格格点的依赖关系;步骤2、对该图G进行基于密铺图的划分,得到多个子图Gi,子图Gi中每个结点Vi沿时间维度更新,直到子图Gi中所有结点若再次更新无法满足结点Vi与边Ei的依赖关系为止,则子图Gi完成了子图最大更新,得到最终子图;步骤3、根据该最终子图中各节点的更新次数,为该最终子图的数据行进行的计算行顺序进行重新排序;步骤4、基于待SpMV的稠密向量,对重新排序后的该最终子图进行矩阵分块计算,得到SpMV计算结果。
全文数据:
权利要求:
百度查询: 中国科学院计算技术研究所 基于密铺的SpMV并行分块计算方法及系统
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