恭喜温州医科大学附属眼视光医院;温州眼视光国际创新中心徐良德获国家专利权
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龙图腾网恭喜温州医科大学附属眼视光医院;温州眼视光国际创新中心申请的专利一种RNA可变区结构的预测方法、设备、介质和程序产品获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN119541629B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-06发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202510096489.5,技术领域涉及:G16B20/20;该发明授权一种RNA可变区结构的预测方法、设备、介质和程序产品是由徐良德;王宏;陆小艳设计研发完成,并于2025-01-22向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种RNA可变区结构的预测方法、设备、介质和程序产品在说明书摘要公布了:本发明提供了一种RNA可变区结构的预测方法、系统、设备、介质和程序产品,涉及生物分析领域。所述方法通过目标RNA得到RNA二级结构集合;对RNA二级结构集合进行聚类分析得到至少2个簇,选取每个簇的质心结构及其能量值;比较所述质心结构的能量值,选取能量值最低的质心结构作为预测的最接近于真实结构的RNA结构。本发明还公开了一种基于SNPs识别RNA结构变化的识别方法、系统、设备、介质和程序产品,通过SNP识别RNA结构的变化。
本发明授权一种RNA可变区结构的预测方法、设备、介质和程序产品在权利要求书中公布了:1.一种基于SNPs识别RNA结构变化的识别方法,其特征在于,所述方法包括:201,获取待测SNPs;202,基于所述待测SNPs调取Ref和Alt序列对,所述序列对应目标RNA;203,提取目标RNA结构的RNA二级结构特征;所述二级结构特征包括B、E、H、I、M、S亚基,以及每个亚基的数量、长度和位置;标准化所述每个亚基的数量、长度和位置,标准化的方法为: 其中,代表任何数值6×2向量,为标准化后的数值,范围为0-1;B、E、H、I、M、S分别表示凸环、外环、发夹环、内环、多分支环、茎;和分别代表由SNP诱导的Ref和AltRNA二级结构;204,采用欧式距离计算B、E、H、I、M、S亚基,以及每个亚基的数量、长度和位置量化Ref序列和Alt序列的结构差异得到差异值;205,基于差异值输出SNPs对RNA结构变化的影响结果;所述提取目标RNA结构的RNA二级结构特征的方法包括:101,获取待预测的目标RNA;102,基于所述目标RNA得到RNA二级结构集合;103,对RNA二级结构集合进行聚类分析得到至少2个簇,选取每个簇的质心结构及其能量值;质心结构的数量与簇的数量一致;104,比较所述质心结构的能量值,选取能量值最低的质心结构作为预测的所述RNA可变区结构。
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