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摘要：本发明提供了一种用于单细胞免疫组库测序数据的降噪方法、设备和存储介质，属于生物信息领域，可对多种组织类型样品的任意单细胞平台下机的单细胞免疫组库测序数据中的单细胞免疫细胞受体基因数据进行校正、比对、定量等质量分析，并根据每个barcode下比对到VDJ基因的reads的UMI数量以及校正reads的UMI数量对VDJ测序数据中所有barcode进行过滤，去除VDJ测序reads中可能存在的背景序列或污染序列，解决了假阳性细胞和低配对率的问题。

主权项：1.用于单细胞免疫组库测序数据的降噪方法，其特征在于，包括如下步骤：S1.从VDJ测序数据中抽取reads，对reads依次进行barcode校正、UMI校正后获得校正reads，从校正reads中提取出比对到VDJ基因的VDJ_reads；其中，所述VDJ_reads包括比对到VDJ轻链基因的VDJ_light_reads，和或比对到VDJ重链基因的VDJ_heavy_reads；S2.根据预设过滤条件对reads中的barcode进行过滤，得到保留barcode；其中所述预设过滤条件根据每个barcode下校正reads的UMI数量、VDJ_light_reads的UMI数量、VDJ_heavy_reads的UMI数量进行设定；S3.重新从VDJ测序数据中提取含有保留barcode的reads，得到保留reads；其中，所述保留reads用于单细胞免疫组库分析；其中，步骤S1中，对reads依次进行barcode校正、UMI校正的方法包括：对reads进行barcode校正后保留含有有效barcode的有效reads；将获得的有效reads中的read2比对至样品对应物种的基因组上，获得比对文件，所述比对文件含有有效reads在基因组上的位置信息；根据有效reads在基因组上的位置信息及其barcode对获得的比对文件进行排序；根据排序结果，对位于同一基因且具有相同barcode的有效reads进行UMI校正，获得校正reads；所述UMI校正是基于HammingDistance进行的，当两个UMI之间HammingDistance≤1，将含有有效reads较少的UMI校正为含有效reads较多的UMI。

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百度查询： 墨卓生物科技(浙江)有限公司 用于单细胞免疫组库测序数据的降噪方法、设备和存储介质