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用于创建和存储图参考基因组的方法和系统 

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摘要:一种用于表示计算机系统的存储器中的图基因组数据结构的计算机实施的方法100,所述方法包括:接收120图参考基因组的定义,所述图参考基因组的定义包括:i多个图基因组边缘,每个图基因组边缘指定字符的序列、以及ii表示所述多个图基因组边缘之间的连接的多个链接;针对接收到的图参考基因组定义来生成130图数据结构,所述图数据结构包括指定多个参考序列的数量的参考序列计数;以及将所生成的图数据结构存储140在存储器中。

主权项:1.一种用于表示计算机系统的存储器中的图基因组数据结构的计算机实施的方法100,所述方法包括:接收120图参考基因组的定义,所述图参考基因组的定义包括:i多个图基因组边缘,每个图基因组边缘指定字符序列;以及ii表示所述多个图基因组边缘之间的连接的多个链接;针对接收到的图参考基因组定义来生成130图数据结构,所述图数据结构包括指定多个参考序列的数量的参考序列计数;所述多个参考序列中的每个参考序列包括:唯一参考序列识别符和指定所述多个图基因组边缘的数量的边缘计数;所述多个图基因组边缘中的每个图基因组边缘包括:i唯一边缘识别符;ii包括由边缘表示的字符序列的边缘序列,所述字符序列可以包括空字符串;以及iii与所述边缘相关联的连接的数量;以及将所生成的图数据结构存储140在存储器中。

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