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一种空间转录组芯片及其制备方法与应用 

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申请/专利权人:上海交通大学

摘要:本发明公开了一种空间转录组芯片及其制备方法与应用。本发明方法包括如下步骤:将基底清洗,放入疏水性硅烷溶液中浸泡,然后使用强腐蚀性试剂或激光刻蚀点阵,再依次加入Spacer试剂、Unylinker分子处理,在其上通过3D喷墨打印或者光化学原位合成设备合成用于空间转录组分析的DNA序列,采用凝胶或收缩薄膜捕获所述DNA阵列芯片的DNA序列,得到包含了捕获序列点阵的凝胶层或收缩薄膜,等比例缩小,将缩小后的凝胶层或收缩薄膜固定到基底上,即得到高空间分辨率、高检测灵敏度的空间转录组芯片。本发明通过序列点阵缩小工艺提高空间转录组分析的空间分辨率和检测灵敏度。

主权项:1.一种空间转录组芯片制备方法,其特征在于,包括如下步骤:1将基底用等离子体机在氧气氛围下清洗,得到预处理的基底;2将所述预处理的基底放入疏水性硅烷溶液中浸泡,然后使用强腐蚀性试剂或激光刻蚀点阵,再依次加入Spacer试剂、Unylinker分子处理,得到表面处理的功能图案化芯片;3在所述表面处理的功能图案化芯片上通过3D喷墨打印或者光化学原位合成设备合成用于空间转录组分析的DNA序列,得到DNA阵列芯片;4采用凝胶或收缩薄膜捕获所述DNA阵列芯片的DNA序列,得到包含了捕获序列点阵的凝胶层或收缩薄膜;5将所述包含了捕获序列点阵的凝胶层或收缩薄膜,等比例缩小体积或面积,得到缩小后的凝胶层或收缩薄膜;6将所述缩小后的凝胶层或收缩薄膜固定到基底上,即得到高空间分辨率、高检测灵敏度的空间转录组芯片。

全文数据:

权利要求:

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