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适用于多倍体物种染色体区段鉴定的高通量分子标记开发方法 

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申请/专利权人:电子科技大学

摘要:本发明提供了一种适用于多倍体物种染色体区段鉴定的高通量分子标记开发方法,根据公布的小麦与目标近缘属物种基因组序列信息,发掘小麦与外源物种基因组的单染色体单拷贝序列库。针对获得单拷贝寡核苷酸序列库,建立混合探针,进行染色体荧光原位杂交验证其染色体特异性;进一步从目标染色体或染色体区段的单拷贝序列,设计分子标记引物,获得高通量目标PCR引物,用于跟踪和检测多倍体材料中的小麦或外源染色体与区段的断裂与变异。本发明的方法获得的寡核酸探针的染色体特异性强,可以区分小麦和外源物种的部分同源染色体,避免了小麦族植物的大基因组中重复序列和染色体部分同源关系的干扰,所设计的寡核酸探针与PCR引物具有高检出率,结果可靠。

主权项:1.一种适用于多倍体物种染色体区段鉴定的高通量分子标记开发方法,其特征在于,其包括如下步骤:步骤1:根据公布的多倍体物种和目标近缘属物种基因组序列,通过叠加的方式,利用生物信息学软件,发掘单个染色体特异的基于45bp单拷贝序列的寡核苷酸库;步骤2:将寡核苷酸混合池经末端连接特异标记,获得标记的目标染色体或染色体区段的寡核苷酸混合探针;利用多倍体物种体细胞有丝分裂中期染色体进行原位杂交分析;步骤3:利用染色体特异目标区段的单拷贝序列的寡核苷酸,开发分子标记引物,用于小麦-外源后代的结构变异的高通量分子检测。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 电子科技大学 适用于多倍体物种染色体区段鉴定的高通量分子标记开发方法

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