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氨基酸变异注释方法、装置、存储介质和电子设备 

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申请/专利权人:中国科学院微生物研究所

摘要:本公开的实施例提供的氨基酸变异注释方法、装置、存储介质和电子设备,包括:对于待注释变异序列信息集合中的待注释变异序列信息,执行以下氨基酸变异注释操作:根据待注释变异序列信息和相应参考序列信息生成待注释单核苷酸多态性SNP信息集合;基于待注释变异序列信息中满足预设注释条件的碱基位点生成候选注释变异碱基位点集合;基于待注释SNP信息集合中的完整密码子SNP信息生成待注释完整密码子SNP信息集合;基于完整密码子SNP信息集合以及待注释变异序列信息和相应参考序列信息,确定待注释变异序列信息相对相应参考序列信息的氨基酸变异注释结果,不是通过单个的SNP氨基酸获得氨基酸变异注释结果。

主权项:1.一种氨基酸变异注释方法,其特征在于,所述方法包括:对于待注释变异序列信息集合中的待注释变异序列信息,执行以下氨基酸变异注释操作:根据待注释变异序列信息和相应参考序列信息生成待注释单核苷酸多态性SNP信息集合,其中,参考序列信息包括参考序列标识、参考序列和相应密码子序列,待注释SNP信息包括变异序列标识、变异碱基位置、变异碱基、参考碱基位置、参考碱基和参考序列标识;基于所述待注释变异序列信息中满足预设注释条件的碱基位点生成候选注释变异碱基位点集合;基于所述待注释SNP信息集合中的完整密码子SNP信息生成待注释完整密码子SNP信息集合,其中,完整密码子SNP信息中的参考碱基对应的密码子中的各参考碱基位点均对应有候选注释变异碱基位点;基于所述完整密码子SNP信息集合以及所述待注释变异序列信息和相应参考序列信息,确定所述待注释变异序列信息相对相应参考序列信息的氨基酸变异注释结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 中国科学院微生物研究所 氨基酸变异注释方法、装置、存储介质和电子设备

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