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申请/专利权人:中国科学院深圳先进技术研究院
摘要:本发明公开了一种疾病靶点预测模型训练方法及系统,属于医疗诊断技术领域,训练方法包括:从数据库获取基因芯片的SNP位点;对基因芯片的SNP位点进行特征初筛,经过特征初筛后,对一维基因序列进行独热编码,得到每个基因原始矩阵,形成样本数据;将经过初筛后得到的样本数据划分为训练集和测试集,在训练集上利用基因芯片数据和GO信息构建基因超图网络,基因超图网络进行拆分,以节点图网络对应基因,超边对应基因的生物通路,将样本数据中基因原始矩阵作为输入,输出预测疾病的连续值,训练得到超图嵌入模型,并在测试集上进行验证,得到疾病靶点预测模型。本发明利用GO信息构建基因的超图嵌入,提高基因的表征能力,以更好地对疾病进行预测。
主权项:1.一种疾病靶点预测模型训练方法,其特征在于,包括:从数据库获取基因芯片的SNP位点;对基因芯片的SNP位点进行特征初筛,经过特征初筛后,对一维基因序列进行独热编码,得到每个基因原始矩阵,形成样本数据;将经过初筛后得到的样本数据划分为训练集和测试集,在训练集上利用基因芯片数据和GO信息构建基因超图网络,基因超图网络进行拆分,以节点图网络对应基因,超边对应基因的生物通路,将样本数据中基因原始矩阵作为输入,输出预测疾病的连续值,训练得到超图嵌入模型,并在测试集上进行验证,得到疾病靶点预测模型。
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百度查询: 中国科学院深圳先进技术研究院 疾病靶点预测模型训练方法及系统
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