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一种基于DEL平台的PROTAC分子药物设计方法 

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申请/专利权人:上海药明康德新药开发有限公司

摘要:本发明公开了一种基于DEL平台的PROTAC分子药物设计方法,包括生成双功能分子、生成PROTAC‑likeDEL双功能分子库,以及利用双功能分子介导的蛋白降解靶向嵌合体系对PROTAC‑likeDEL双功能分子库中的双功能分子进行评估。本发明基于DEL平台,通过分子生成模型和计算机辅助药物设计快速生成和评估双功能分子,加速了PROTAC‑likeDEL双功能分子库的构建,再通过对双功能分子介导的蛋白‑双功能分子三元复合物体系建模和模拟,对PROTAC‑likeDEL双功能分子库的双功能分子的结合模式进行预测,进一步优化双功能分子,使设计的双功能分子更具合理性,很大程度降低了分子的合成难度。

主权项:1.一种基于DEL平台的PROTAC分子药物设计方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤S1、生成双功能分子:基于弹头分子和E3连接酶配体,利用分子生成模型生成多组弹头分子-连接子-E3连接酶配体的双功能分子;步骤S2、生成PROTAC-likeDEL双功能分子库:对步骤S1生成的双功能分子进行筛选和评估,将符合规格的双功能分子加入到DEL库中,生成PROTAC-likeDEL双功能分子库,并对其进行KL散度评估;步骤S3、利用双功能分子介导的蛋白降解靶向嵌合体系对PROTAC-likeDEL双功能分子库中的双功能分子进行评估。

全文数据:

权利要求:

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