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申请/专利权人：云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所

摘要：本发明是一种香石竹品种鉴定的特异性SNP分子标记组合及应用，特异性SNP分子标记组合包括30个位点DSNP001～DSNP030，通过设计特异性引物进行SNP位点扩增，根据突变类型的分型结果实现香石竹品种快速鉴定。本发明的技术方案采用目前国际国内品种鉴定领域均认可的SNP标记技术，以基于KASP技术的多种荧光扫描平台如GeneMatrix、LGC‑SNPline、DouglasArrayTape等平台为主，与基于田间试验的品种鉴定技术相比不受环境影响和季节约束；与SSR分子标记相比检测通量高、数据统计分析简单、数据兼容性强、易实现数据共享，弥补了目前缺少香石竹品种鉴定技术方法的空白，实现了香石竹DNA指纹图谱构建、香石竹品种快速鉴定、对未知品种进行鉴定或者分子育种辅助。

主权项：1.香石竹品种鉴定的特异性SNP分子标记引物对，其特征在于，所述特异性SNP分子标记引物对由30个SNP位点的检测引物组成，检测各SNP位点的引物由两条正向引物和一条反向引物组成，其序列为：DSNP001正向引物1序列为：5’-ATGGTGAGCCAATGATCGGTAGAT-3’DSNP001正向引物2序列为：5’-GGTGAGCCAATGATCGGTAGAG-3’DSNP001反向引物序列为：5’-ATATATGGCGTGGCATCCGGCAAAT-3’DSNP002正向引物1序列为：5’-CGTGAGGTGATGCAGATGTTGAA-3’DSNP002正向引物2序列为：5’-GTGAGGTGATGCAGATGTTGAG-3’DSNP002反向引物序列为：5’-TCTGCAACAATCGTGCGCTAACCTT-3’DSNP003正向引物1的序列为：5’-CCTGTCTTCCTCAGATAGCCTC-3’DSNP003正向引物2的序列为：5’-TCCTGTCTTCCTCAGATAGCCTT-3’DSNP003反向引物的序列为：5’-GCAAAAGTAGACCCTCTTCTCGCTA-3’DSNP004正向引物1的序列为：5’-GTTCTGACACTGCCGTCTCG-3’DSNP004正向引物2的序列为：5’-AAGTTCTGACACTGCCGTCTCA-3’DSNP004反向引物的序列为：5’-ATACACATGTGCGGTCACTGGTGAA-3’DSNP005正向引物1序列为：5’-CGATTACTTCTAAATGTCAGGAAGTTC-3’DSNP005正向引物2序列为：5’-GTCGATTACTTCTAAATGTCAGGAAGTTT-3’DSNP005反向引物序列为：5’-CAGCCATTTGAGCCGAATCTCTCAA-3’DSNP006正向引物1序列为：5’-CATCACGAAGACCTGTTATCGAG-3’DSNP006正向引物2序列为：5’-CCATCACGAAGACCTGTTATCGAA-3’DSNP006反向引物序列为：5’-CTGGAGGGGATATCGTCTTGTCTAA-3’DSNP007正向引物1序列为：5’-ATCGTTCAACATCATTGACCACATAAGA-3’DSNP007正向引物2序列为：5’-CGTTCAACATCATTGACCACATAAGG-3’DSNP007反向引物序列为：5’-CGGTCGAGTGGCTGGAAATAAAGAT-3’DSNP008正向引物1序列为：5’-TTGCTGGTGTTCGCCTTGCC-3’DSNP008正向引物2序列为：5’-TATTGCTGGTGTTCGCCTTGCT-3’DSNP008反向引物序列为：5’-GGTGCAACAAGGCTTCAGCATAGTT-3’DSNP009正向引物1序列为：5’-GCAGGGGTTGTTTGAGCATCGA-3’DSNP009正向引物2序列为：5’-CAGGGGTTGTTTGAGCATCGG-3’DSNP009反向引物序列为：5’-CCGTCTCCGTAGCTTAGTGTCTTAA-3’DSNP010正向引物1序列为：5’-TCTGCCACAGTCACACGTAT-3’DSNP010正向引物2序列为：5’-TCTGCCACAGTCACACGTAA-3’DSNP010反向引物序列为：5’-GTGGCGTTGTTAGGGTATGGA-3’DSNP011正向引物1序列为：5’-GCCAGCTCTAATATGCTACACC-3’DSNP011正向引物2序列为：5’-GTGCCAGCTCTAATATGCTACACT-3’DSNP011反向引物序列为：5’-CAGCACGCCGTTTTGCTTCATTCAA-3’DSNP012正向引物1序列为：5’-CAGAGATCACTGTCCTTAGAGTAC-3’DSNP012正向引物2序列为：5’-CCAGAGATCACTGTCCTTAGAGTAT-3’DSNP012反向引物序列为：5’-TCCTAGGATTGCAAGTGGATCGGTT-3’DSNP013正向引物1序列为：5’-CCGCCTATGCAAATGCCGCCA-3’DSNP013正向引物2序列为：5’-CGCCTATGCAAATGCCGCCG-3’DSNP013反向引物序列为：5’-ATGTTGCTGCAGCTCCTAAAGGGAA-3’DSNP014正向引物1序列为：5’-GTTATGACTGCAGCTTGCTGGTG-3’DSNP014正向引物2序列为：5’-AAGTTATGACTGCAGCTTGCTGGTA-3’DSNP014反向引物序列为：5’-GAAGGGCATCCCAGAGATTTCCATT-3’DSNP015正向引物1序列为：5’-CCTTCAATCTTCGTGTAAGACCCT-3’DSNP015正向引物2序列为：5’-CTTCAATCTTCGTGTAAGACCCC-3’DSNP015反向引物序列为：5’-GAGAGGAGACGTCAGAGCTCAATAA-3’DSNP016正向引物1序列为：5’-CAAAAGCGTCTGACAGTGAGTT-3’DSNP016正向引物2序列为：5’-CAAAAGCGTCTGACAGTGAGTG-3’DSNP016反向引物序列为：5’-CATGGCTTCCACTGGGAGAG-3’DSNP017正向引物1序列为：5’-GAAATGTACCTTACAGAATTTTTTTCGGTTT-3’DSNP017正向引物2序列为：5’-GAAATGTACCTTACAGAATTTTTTTCGGTTA-3’DSNP017反向引物序列为：5’-CTTGCTGCGCCTTGAAGTATTCCTA-3’DSNP018正向引物1序列为：5’-CAAATCAACTCGGTATACTCCAGG-3’DSNP018正向引物2序列为：5’-CAAATCAACTCGGTATACTCCAGC-3’DSNP018的反向引物序列为：5’-GTGGTTGAGCTTGCAAGAGC-3’DSNP019正向引物1序列为：5’-AGAAACATCTATAAAAACTTTATATAGGGTTG-3’DSNP019正向引物2序列为：5’-AGAAACATCTATAAAAACTTTATATAGGGTTC-3’DSNP019反向引物序列为：5’-AGCACAGATGAGTGCCCTCTATCAT-3’DSNP020正向引物1序列为：5’-CCATTTCCCTAGGTAAGGTTGGA-3’DSNP020正向引物2序列为：5’-CATTTCCCTAGGTAAGGTTGGG-3’DSNP020反向引物序列为：5’-GAGGTACTTTGTGCAAGGCCTGTTA-3’DSNP021正向引物1序列为：5’-GAAGCACGGGGCCGTAAGAG-3’DSNP021正向引物2序列为：5’-AAAGAAGCACGGGGCCGTAAGAA-3’DSNP021反向引物序列为：5’-GAACAACAATCTTTGGGGCCGTCTT-3’DSNP022正向引物1序列为：5’-CCTGAAGCGTAGGATCAACCA-3’DSNP022正向引物2序列为：5’-CCTGAAGCGTAGGATCAACCT-3’DSNP022反向引物序列为：5’-TGTAGTCGATGAGCAGCTCGT-3’DSNP023正向引物1序列为：5’-CCAACTGATTATGATCCAAAACGACG-3’DSNP023正向引物2序列为：5’-CCAACTGATTATGATCCAAAACGACC-3’DSNP023反向引物序列为：5’-GATTCCCAAGGAAATGGTTGCGCTT-3’DSNP024正向引物1序列为：5’-ACCTCAGACGCCTCCTACTC-3’DSNP024正向引物2序列为：5’-ACCTCAGACGCCTCCTACTA-3’DSNP024反向引物序列为：5’-GTTGGATTGGTGGGCCCATA-3’DSNP025正向引物1序列为：5’-GCTTCCTAATGTTTCCCTGTTCACT-3’DSNP025正向引物2序列为：5’-GCTTCCTAATGTTTCCCTGTTCACC-3’DSNP025反向引物序列为：5’-TGTATGCGCGTGATCCTGATCT-3’DSNP026正向引物1序列为：5’-AAGGTTCATCGAATTTGCATAACGAATG-3’DSNP026正向引物2序列为：5’-AAAAAGGTTCATCGAATTTGCATAACGAATT-3’DSNP026反向引物序列为：5’-CGATTCCATCCTTTGGGATCCTGAT-3’DSNP027正向引物1序列为：5’-GTGCTAGAGAACATTAGAAAAACAGCT-3’DSNP027正向引物2序列为：5’-GCTAGAGAACATTAGAAAAACAGCC-3’DSNP027反向引物序列为：5’-AATCGAGAAGGCCGGTGTGCTAAAT-3’DSNP028正向引物1序列为：5’-GGACCGGGTAGGTTAAGACG-3’DSNP028正向引物2序列为：5’-GGGACCGGGTAGGTTAAGACA-3’DSNP028反向引物序列为：5’-GCTTTGATGCTCTCACTCTCGAGAA-3’DSNP029正向引物1序列为：5’-AAACAAAACCTCTGGGAAGGGGAA-3’DSNP029正向引物2序列为：5’-CAAAACCTCTGGGAAGGGGAG-3’DSNP029反向引物序列为：5’-CCGAGACACTTGGATCATGATCCTT-3’DSNP030正向引物1序列为：5’-CGATATTAGCTATGAGAAAACCACTTGTT-3’DSNP030正向引物2序列为：5’-GATATTAGCTATGAGAAAACCACTTGTC-3’DSNP030反向引物序列为：5’-GCATGGCGTCTAGAAGGTTAGAGTA-3’。

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百度查询： 云南省农业科学院质量标准与检测技术研究所 香石竹品种鉴定的特异性SNP分子标记组合及应用