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基于变分贝叶斯多输出高斯过程回归的代谢物预测方法 

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申请/专利权人:江南大学

摘要:本发明公开了基于变分贝叶斯多输出高斯过程回归的代谢物预测方法,属于多组学预测技术领域。所述方法通过高斯过程确定需采样的数据点,设定均值和协方差函数,根据后验概率确定预测点的表达式,通过估计求解超参数,并替换数据以生成结果。变分贝叶斯多输出高斯过程回归在高斯过程回归的基础上同时对多个输出变量进行建模,并利用特征之间的共享信息以提高预测性能,在多个数据集上表现出了出色的性能,成功预测了高水平代谢物的数量,从而在预测性能方面取得了显著的成果。本发明提供了一种多组学预测技术手段,可用于预测肠道微生物代谢物,该方法是一个非参数模型,能够适应不同大小的数据集。

主权项:1.一种肠道代谢物预测方法,其特征在于,所述方法包括:步骤1:获取人体肠道菌群丰度数据和代谢物丰度数据;步骤2:对所述菌群丰度数据和代谢物丰度数据进行预处理,包括clr中心对数转换和降维;步骤3:将预处理过后的菌群丰度数据和代谢物丰度数据代入到算法框架中进行训练得到代谢物预测模型,所述算法框架利用变分贝叶斯多输出高斯过程回归预测代谢物丰度值;步骤4:将待预测用户的肠道菌群丰度值输入训练好的代谢物预测模型,得到人体肠道代谢物丰度值。

全文数据:

权利要求:

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