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一种基于CNN-Attention-GNN模型的多肽结构鉴定方法及其应用 

申请/专利权人:五邑大学

申请日:2024-06-06

公开(公告)日:2024-07-05

公开(公告)号:CN118298928A

主分类号:G16B40/00

分类号:G16B40/00;G16B20/00;G16B5/00;G06N3/042;G06N3/045;G06N3/0464;G06N3/08;G06F18/10;G06F18/21;G06F18/22

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.07.23#实质审查的生效;2024.07.05#公开

摘要:本发明公开了一种基于CNN‑Attention‑GNN模型的多肽结构鉴定方法及其应用,方法包括:对收集的多肽质谱信息进行预处理,建立标准化多肽数据集;设计并训练基于CNN‑Attention‑GNN架构模型,模型包括:肽离子峰鉴定层用于识别质谱峰中的碎片离子;节点嵌入层则通过卷积神经网络和自注意力机制进行特征提取,以捕捉有意义的信息;图神经网络层负责捕捉质谱峰中碎片离子之间的复杂关系,以提升模型推断的准确性;输出层通过Softmax和全连接层等操作生成最终的多肽序列;最后,将待测质谱数据输入训练好的模型,生成预测结果。本发明通过结合CNN网络、自注意力机制、图神经网络以及多肽谱峰间的相关联系,为生物领域的研究和生物活性肽的发展提供坚实基础。

主权项:1.一种基于CNN-Attention-GNN模型的多肽结构鉴定方法,其特征在于,包括如下步骤:S1:获取多肽质谱信息,并将多肽质谱信息进行预处理,得到标准数据集;S2:构建多肽结构鉴定基础模型,并将所述数据集输入模型进行学习,得到训练模型;S3:将待测质谱数据输入所述训练模型,获得预测结果。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 五邑大学 一种基于CNN-Attention-GNN模型的多肽结构鉴定方法及其应用

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