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申请/专利权人：四川大学华西医院
申请日：2024-04-01
公开（公告）日：2024-07-05
公开（公告）号：CN118291609A
主分类号：C12Q1/6883
分类号：C12Q1/6883;C12Q1/6869;C12Q1/6844;C12N15/11;G16H50/30;G16H50/70;G16B30/00;G16B20/00
优先权：
专利状态码：在审-实质审查的生效
法律状态：2024.07.23#实质审查的生效;2024.07.05#公开
摘要：本发明提供了一种基于DNA甲基化预测渐冻症患者生存时间的方法，涉及渐冻症患者生存时间的预测领域。包括：对目标患者进行资料收集，得到数据样本；对目标患者DNA进行甲基化测序，得到测序数据；对测序数据进行质控与比对，得到甲基化数据；对甲基化数据进行DNA甲基化差异分析，得到具有统计学显著性的差异甲基化位点和差异甲基化区域；以DNA甲基化水平作为自变量，以生存时间和生存状态为因变量，建立ROC曲线；基于各时间点的ROC曲线下面积，筛选出用于预测渐冻症患者生存时间的基因片段。本发明为渐冻症患者的生存时间预测提供了更准确的生物标志物模型，并有望在未来对渐冻症的临床试验疗效评估方面产生积极影响。
主权项：1.一种基于DNA甲基化预测渐冻症患者生存时间的方法，其特征在于，包括如下步骤：对目标患者进行资料收集，得到数据样本；所述数据样本包括年龄、性别、生存时间和生存状态；对所述目标患者的DNA进行甲基化测序，得到测序数据；对所述测序数据进行质控与比对，得到甲基化数据；所述甲基化数据包括测序深度和甲基化程度；根据生存时间将所述目标患者分为第一组和第二组，并分别对第一组所述目标患者和第二组所述目标患者的甲基化数据进行生存时间相关的DNA甲基化差异分析，得到具有统计学显著性的差异甲基化位点和差异甲基化区域；以第一组所述目标患者和第二组所述目标患者共同的差异甲基化区域的DNA甲基化水平作为自变量，以所述目标患者的生存时间和生存状态为因变量，建立时间依赖的ROC曲线，基于所述ROC曲线得到各个时间点的ROC曲线下面积，并根据所述ROC曲线下面积筛选出用于预测所述患者生存时间的基因片段。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 四川大学华西医院 一种基于DNA甲基化预测渐冻症患者生存时间的方法
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