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一种基于非靶向代谢组学检测GIST患者血浆中伊马替尼代谢物的方法 

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申请/专利权人:四川省肿瘤医院

摘要:本发明公开了一种基于非靶向代谢组学检测GIST患者血浆中伊马替尼代谢物的方法,采集若干名未服用及长期规律服用IM的GIST患者外周静脉血,进行处理后,采用UPLC‑QTOFMS联用技术对待测样本进行非靶向检测,得到血浆中的代谢物原始数据,对原始数据进行无监督主成分分析分析PCA、正交偏最小二乘法判别分析OPLS‑DA、Student’st‑test和差异倍数分析FoldChange,并寻找差异代谢物,检索数据库定性出GIST代谢标志物。为适用于IM治疗的GISI患者的有效性治疗提供技术支撑,可为消化道肿瘤确诊后的药物治疗有效性、针对性及无创筛选、标志物表征奠定基础。

主权项:1.一种基于非靶向代谢组学检测GIST患者血浆中伊马替尼代谢物的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、分别采集若干名未服用及长期规律服用IM的GIST患者的外周静脉血,并将采集的外周静脉血进行离心处理,然后低温保存,得到血浆样本;S2、采用二维液相色谱法分析血浆样本中IM血药浓度,根据测出的血药浓度值,将所述的血浆样本分成A、B、C、D组;其中,将血浆样本编号为1-40,采用二维液相色谱法依次分析已编号的血浆样本中IM血药浓度,根据测出的血药浓度值,将IM血药浓度>2000ngmL的设为A组、IM血药浓度1100-2000ngmL的设为B组、IM血药浓度<1100ngmL的设为C组和未服用IM的GIST患者设为D组;S3、样本处理,分别量取100μL的A、B、C、D组的血浆样本转移到1.5mL离心管中,加入300μL含有1ppm的2-氯苯丙氨酸的甲醇中使用涡旋2min,于-20℃下冰箱孵育0.5h;取孵育后的样本涡旋2min,于4℃下12000rmin离心处理10min,收取200μL上清液转置新的1.5mL离心管中,于-20℃下静置0.5h;静置后的上清液于4℃下12000rmin再次离心15min,转置进样瓶中,得到待测样本,其中涡旋处理采用涡旋混合器,离心处理采用离心机,温度设置采用超低温冰箱;S4、对待测样本进行非靶向检测,得到血浆中的代谢物原始数据;其中,非靶向检测,采用UPLC-QTOFMS联用技术对待测样本进行非靶向检测,依次取样,得到血浆样本中的代谢物原始数据;UPLC:WatersT3C18柱,i.d.2.1×100mm,1.8μm,柱温40℃,流速0.35mLmin,进样量2μL,0.04%乙酸水的流动相A,0.04%乙酸乙腈的流动相B,从开始到10min,A泵的流动相比例从95%匀速减少为5%,同时B泵的流动相比例从5%匀速增长为95%;从10min到11min保持上述比例;从11min到11.1minA泵的流动相比例从5%匀速增长为95%,同时B泵的流动相比例从95%匀速减少为5%;保持至14min;QTOFMS:正离子模式下:电压Voltage:250v;气体流量GasFlow:8Lmin;碎裂电压Fragmentor:135v;气体温度GasTemperature:325℃;鞘气温度SheathTemperature:325℃;鞘流SheathFlow:11Lmin;喷雾器Nebulizer:40psi;负离子模式下:电压Voltage:1500v;气体流量GasFlow:8Lmin;碎裂电压Fragmentor:135v;气体温度GasTemperature:325℃;鞘气温度SheathTemperature:325℃;鞘流SheathFlow:11Lmin;喷雾器Nebulizer:40psi;S5、对原始数据进行多变量分析,并以OPLS-DA模型的变量投影重要度值,即VIP值结合t检验的P值以及差异倍数分析的FC值,并以VIP≥1,P0.05,FC≥2或≤0.5的条件寻找差异代谢物,检索数据库以定性出GIST代谢标志物;S6、对代谢标志物进行KEGG通路分析,确定GISI患者的代谢过程,所述通路为鞘脂代谢、P450代谢、咖啡因代谢、维生素消化吸收,所述鞘脂代谢包括D-鞘氨醇、1-磷酸鞘氨醇、植物鞘氨醇、磷酸乙醇胺。

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