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用于扩增EGFR-T790M基因变异的blocker探针、引物组及其应用 

申请/专利权人:珠海圣美生物诊断技术有限公司

申请日:2022-06-06

公开(公告)日:2023-03-28

公开(公告)号:CN115851928A

主分类号:C12Q1/6886

分类号:C12Q1/6886;C12Q1/6851;C12N15/11

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2023.04.14#实质审查的生效;2023.03.28#公开

摘要:本发明涉及基因检测技术领域,尤其是涉及用于扩增EGFR‑T790M基因变异的blocker探针、引物组及其应用。本发明提供的blocker探针长度小于20nts,同时突变位点两侧1或2nts范围内的锁核酸修饰又能够保证其与野生型模板结合的热稳定性。此外,本发明还提供了用于扩增EGFR‑T790M基因变异的引物组,该引物组包含上述blocker探针,同时还包括与该blocker探针搭配使用的两条上游引物,两条上游引物的设置能够避免SNP位点rs1050171存在G>A突变时,假阴性结果的出现。

主权项:1.用于扩增EGFR-T790M基因变异的blocker探针,其特征在于,1所述blocker探针的核苷酸序列覆盖EGFR-T790M基因突变位点,与野生型EGFR-T790M基因片段完全匹配,与突变型EGFR-T790M基因片段在突变位点错配;2所述blocker探针核苷酸序列长度小于20nts,其中突变位点及两侧1或2nts范围内对应碱基经过锁核酸修饰;所述blocker探针的核苷酸序列从5’端到3’端为或与其严格杂交的互补序列,所述Xm为突变位点上游m个与野生型EGFR-T790M基因片段完全匹配核苷酸,所述Xn为突变位点下游n个与野生型EGFR-T790M基因片段完全匹配核苷酸,所述m+n<15,所述blocker探针中斜体并字体加粗标出的核苷酸对应突变位点,下划线表示该核苷酸经过锁核酸修饰,所述突变位点上游的CA和突变位点下游的GC中至少有一个核苷酸经过锁核酸修饰;所述m≤5。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 珠海圣美生物诊断技术有限公司 用于扩增EGFR-T790M基因变异的blocker探针、引物组及其应用

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