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一种小分子RNA的高通量测序文库构建方法 

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申请/专利权人:深圳大学

摘要:本发明公开了一种小分子RNA的高通量测序文库构建方法,其包括步骤:提取待测样品中的RNA;使用polyA加尾酶和MMLV逆转录酶,结合带有polyT的逆转录引物对所述RNA进行加尾和逆转录,得到反应体系产物,所述反应体系产物包括合成的cDNA第一链;利用外切酶I清除反应体系产物中剩余的逆转录引物;对所述cDNA第一链进行变性后与末端突出的双链DNA接头进行连接,得到连接产物;对所述连接产物用USER酶处理,得到处理后cDNA;对处理后cDNA进行PCR扩增,得到高通量测序文库。本发明实现了对血浆中极其微量的smallRNA的文库构建,本发明不依赖于RNA5’端为磷酸化修饰,因而可以对更多不同类型的RNA进行文库构建。

主权项:1.一种小分子RNA的高通量测序文库构建方法,其特征在于,包括步骤:提取待测样品中的RNA,备用;将待测样品中的RNA和结合带有polyT的逆转录引物混合,制备成混合样品后置于70℃孵育2min后立即放置于冰上,备用;将PolyA加尾缓冲液、逆转录缓冲液、PolyA加尾酶、MMLV逆转录酶混合在一起,得到反应液;将反应液与放置于冰上的混合样品混匀后置于37℃孵育30min后得到反应体系产物,所述反应体系产物包括合成的cDNA第一链;将外切酶I加入到反应体系产物中,在37℃保温30min,接着以80℃保温20min,清除反应体系产物中的逆转录引物;对所述cDNA第一链进行95℃5min孵育使其变性,得到变性cDNA第一链;使用末端突出的双链DNA接头与变性cDNA第一链在20℃保温1h,接着在65℃保温15min的条件下进行连接,得到连接产物;利用USER酶对所述连接产物进行37℃15min处理,得到处理后cDNA;对处理后cDNA进行PCR扩增,得到高通量测序文库;所述带有polyT的逆转录引物包含8bp的样本标识碱基;所述末端突出的双链DNA接头,末端突出的为6个兼并碱基。

全文数据:

权利要求:

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