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申请/专利权人：杭州链康医学检验实验室有限公司
摘要：本发明公开了一种构建标记微卫星位点稳定性预测模型的方法，属于MSI检测技术领域。本发明通过已知微卫星位点建立回归模型，预测22个标记微卫星位点的稳定性。利用本发明的方法获得标记微卫星位点的稳定性数据，可进一步建立机器学习模型预测MSI总体状态。利用本发明，通过对二代测序数据的分析可在不同NGS检测平台、不同癌种中，无需正常样本配对即可进行MSI总体状态预测，稳定快捷，结果准确，可重复性高，减少了检测的局限性。
主权项：1.一种构建标记微卫星位点稳定性预测模型的方法，其特征在于，利用第一群体样本已知微卫星位点长度的峰数、峰度、偏度、标准差和标准偏移以及稳定性数据构建所述标记微卫星位点稳定性预测模型，其中，所述已知微卫星位点包括： 位点编号 染色体 位置 重复单元 重复次数 1 chr11 102193508 A 26 2 chr14 23652346 A 21 3 chr4 55598211 T 25 4 chr2 95849361 T 23 5 chr2 47641559 A 27 6 chr2 39564893 T 28 所述标记微卫星位点包括： 所述方法包括以下步骤：S11，将第一群体样本的已知微卫星位点长度的峰数、峰度、偏度、标准差和标准偏移以及稳定性数据随机分为两组，一组为第一训练集，一组为第一测试集；S12，利用第一训练集数据，基于回归算法构建标记微卫星位点稳定性预测模型；S13，在第一测试集中，对得到的所述标记微卫星位点稳定性预测模型进行验证。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 杭州链康医学检验实验室有限公司 一种构建标记微卫星位点稳定性预测模型的方法
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