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申请/专利权人：染色质(北京)科技有限公司
摘要：本发明涉及一种用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的方法，一种存储用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的程序的非瞬态计算机可读介质，以及用于诊断和治疗医学病症或疾病的方法。用于从Hi‑C矩阵中识别染色质结构特征的方法包括对所述Hi‑C矩阵进行相关处理，计算出相关矩阵；基于所述相关矩阵，计算结构特征向量；根据所述结构特征向量，计算主成分分数矩阵；以及识别所述主成分分数矩阵中的至少一种染色质结构特征。
主权项：1.一种用于从Hi-C矩阵中识别染色质结构特征的方法，所述方法包括：对所述Hi-C矩阵进行相关处理，计算出相关矩阵；基于所述相关矩阵，计算一维结构特征向量；所述基于所述相关矩阵，计算所述一维结构特征向量包括计算所述相关矩阵的分位数，以及对于每个位点计算窗口中相邻位点之间的平均相似度，基于所述窗口的大小，根据所述相关矩阵生成子矩阵，将所述子矩阵平均为长度等于染色质箱的数量的所述一维结构特征向量；其中，所述计算所述相关矩阵的分位数包括将所述相关矩阵转换为二元矩阵，将大于所述分位数的矩阵元素转换为1或0，且将小于所述分位数的矩阵元素转换为1或0中的另一个；根据所述一维结构特征向量，计算主成分分数矩阵；所述根据所述一维结构特征向量计算主成分分数矩阵包括，将所述一维结构特征向量拼接成具有限定形状的输入矩阵，以使所述输入矩阵的每一行均为一维结构特征向量；归一化所述输入矩阵；进行矩阵分解和降维，得到系数矩阵和所述主成分分数矩阵；识别所述主成分分数矩阵中的至少一种染色质结构特征；所述识别所述主成分分数矩阵中的至少一种染色质结构特征包括进行几何可视化，所述几何可视化为可视化的细胞类型图谱。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 染色质(北京)科技有限公司 用于从Hi-C矩阵识别染色质结构特征的方法、存储用于从Hi-C矩阵中识别染色质结构特征的程序的非瞬态计算机可读介质
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