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一种前列腺癌谱系可塑性相关的新型细胞及其鉴定方法与应用 

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申请/专利权人:海南大学

摘要:本发明提供了一种前列腺癌谱系可塑性相关的新型细胞及其鉴定方法与应用,本发明发现并验证了一种从未被描述的谱系可塑性高度相关的前列腺癌上皮细胞类型LPCs,通过本发明鉴定得到的前列腺癌谱系可塑性相关基因签名LPSig以及LPCs特异性基因标志物如HMMR、EZH2和AURKA等,可识别前列腺癌微环境中的LPCs细胞亚群,为前列腺癌生物标志物的研究提供了新方向,同时也为前列腺癌患者的个性化精准治疗提供了新的可能性。

主权项:1.一种前列腺癌谱系可塑性相关的新型细胞的鉴定方法,包括:1基于PCaProfilerbulkRNA-seq队列进行WGCNA分析,并结合NEPAL模型构建前列腺癌的谱系可塑性相关基因签名LPSig,所述队列包括非肿瘤前列腺、原发性前列腺癌、去势抵抗性前列腺癌和神经内分泌前列腺癌的人类前列腺癌组织;2基于已发表的人类前列腺癌数据集中生成单细胞转录组图谱,使用LPSig进行AUCell富集分析显示在上皮细胞中有显著的信号,所述单细胞转录组图谱的样本包括正常前列腺、非肿瘤组织相邻部位、原发性前列腺癌、去势抵抗性前列腺癌和转移性去势抵抗性前列腺癌;3针对上皮细胞进行再聚类分析进一步确定5种主要的上皮细胞类型,包括基底细胞、小丘细胞、棒状细胞、腔细胞和神经内分泌细胞,筛选得到LPSig评分最高并与神经内分泌细胞有所不同的新型细胞。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 海南大学 一种前列腺癌谱系可塑性相关的新型细胞及其鉴定方法与应用

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