龙图腾网&IPTOP
- 微信扫码登录
- 账号密码登录
- 短信登录/注册
买专利卖专利找龙图腾，真高效！ 查专利查商标用IPTOP,全免费！专利年费监控用IP管家,真方便！
申请/专利权人：中国科学院微生物研究所
摘要：本发明公开了病原菌中移动元件和可转移功能基因的鉴定方法和系统，所述方法包括：获得病原菌基因组，对所述病原菌基因组上MGE类型进行比对和注释；预测所述病原菌基因组上的可转移功能基因，获得所述可转移功能基因在所述病原菌基因组上的位置信息，所述可转移功能基因包括抗性基因和毒力因子；根据所述可转移功能基因和MGE的位置关系，判断所述可转移功能基因是否存在可水平转移的可能。所述系统包括类型注释模块、位置预测模块和判断模块。本发明实现了同步对比注释出多类型MGE，实现了MGE注释与可水平转移抗性基因和毒力因子检测的判断相结合，为阻断其耐药风险、降低菌株环境适应性的研究提供技术支撑。
主权项：1.病原菌中移动元件和可转移功能基因的鉴定方法，其特征在于，包括：获得病原菌基因组，对所述病原菌基因组上的MGE类型进行比对和注释；比对和注释出的所述MGE类型包括：插入序列、整合接合元件、整合子、质粒、噬菌体和转座子；预测所述病原菌基因组上的可转移功能基因，获得所述可转移功能基因在所述病原菌基因组上的位置信息，所述可转移功能基因包括抗性基因和毒力因子；判断所述可转移功能基因是否存在可水平转移的可能，若满足下述三个判断条件中的至少一个则判断为是：条件1、可转移功能基因的上侧包含第一序列段、下侧包含第二序列段，所述第一序列段和所述第二序列段属于同一个插入序列，所述第一序列段和该可转移功能基因的间距、所述第二序列段和该可转移功能基因的间距均不超过10Kb；条件2、可转移功能基因位于第二序列范围内，所述第二序列范围为病原菌基因组中包含整合接合元件、整合子、质粒、噬菌体和转座子的最短基因序列范围；条件3、可转移功能基因和整合子的间距不超过10Kb。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中国科学院微生物研究所 病原菌中移动元件和可转移功能基因的鉴定方法和系统
免责声明
1、本报告根据公开、合法渠道获得相关数据和信息，力求客观、公正，但并不保证数据的最终完整性和准确性。
2、报告中的分析和结论仅反映本公司于发布本报告当日的职业理解，仅供参考使用，不能作为本公司承担任何法律责任的依据或者凭证。
主营中国专利交易买卖与专利转让许可,高校科技成果推广与科技成果转化,知识产权运营管理与平台开发,科技人才专家库与科技猎头等科技服务
开放平台
担保交易
惠及多方
会员特惠
专属平台
适合多方
数据共享
功能齐全
皖公网安备 34010402703815号