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一种前列腺癌的诊断模型构建方法 

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申请/专利权人:重庆医科大学

摘要:本发明公开了一种前列腺癌的诊断模型构建方法,包括以下步骤:Step1获取PCa的基因表达谱数据;Step2对PCa的基因表达谱数据进行差异表达谱分析,筛选出PCa中的差异基因;Step3针对PCa中的差异基因通过机器学习方法中的GAE算法筛选关键基因;Step4对GAE的计算结果,通过PPI分析得到10个高表达基因和6个低表达基因;Step5通过单因素回归分析和多因素回归分析建立预后模型;Step6根据预后模型参数构建PCa的诊断模型;Step7对PCa诊断模型进行验证。本发明构建并验证了由4个基因构建的PCa诊断模型,这为PCa患者的个性化精准治疗提供了依据。

主权项:1.一种前列腺癌的诊断模型构建方法,其特征在于,包括以下步骤:Step1)获取PCa即ProstateCancer前列腺癌的基因表达谱数据;Step2)对PCa的基因表达谱数据进行差异表达谱分析,筛选出PCa中的差异基因;Step3)针对PCa中的差异基因通过机器学习方法中的GAE即GraphAutoencoder算法筛选关键基因;Step4)对GAE的计算结果,通过PPI分析得到关键基因中的10个高表达基因和6个低表达基因;Step5)通过单因素回归分析和多因素回归分析建立预后模型;所述的建立预后模型的具体方法如下:通过单因素Cox比例风险模型找出与PCa预后相关的关键基因,再通过多因素Cox比例风险模型构建一个基于4个基因的诊断模型,所述诊断模型通过以下公式计算:预后风险指标=0.3153×TOP2A基因表达水平+0.2987×UBE2C基因表达水平+-0.7064×MYL9基因表达水平+-0.4628×FLNA基因表达水平;Step6)根据预后模型参数构建PCa的诊断模型;Step7)对PCa诊断模型进行验证。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 重庆医科大学 一种前列腺癌的诊断模型构建方法

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