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申请/专利权人：北京深势科技有限公司

摘要：本发明实施例涉及一种基于自回归模型处理分子生成任务的系统，所述系统包括：任务调度模块、任务训练模块、任务执行模块、复合物数据库、自回归模型库和任务接口库；任务调度模块进行模型训练参考数据准备得到第一参考数据向任务训练模块发送，并在确认模型训练结束时进行分子生成任务参考数据准备得到第二参考数据向任务执行模块发送，并将收到的生成分子构象向外部接口反馈；任务训练模块根据参考数据和复合物数据库对自回归模型库中的指定模型进行训练；任务执行模块根据参考数据和任务接口库进行分子生成任务执行处理；通过本发明对基于结构的药物设计流程进行改善，可以缩短设计周期、提高设计效率。

主权项：1.一种基于自回归模型处理分子生成任务的系统，其特征在于，所述系统包括：任务调度模块、任务训练模块、任务执行模块、复合物数据库、自回归模型库和任务接口库；所述任务调度模块分别与所述任务训练模块和所述任务执行模块连接；所述任务训练模块分别与所述复合物数据库和所述自回归模型库连接；所述任务执行模块与所述任务接口库连接；所述任务接口库与所述自回归模型库连接；所述任务调度模块用于接收外部接口输入的分子生成任务数据作为对应的第一任务数据；并根据所述第一任务数据进行模型训练参考数据准备得到对应的第一参考数据向所述任务训练模块发送；并在收到所述任务训练模块发送的第一训练状态为模型训练结束时，根据所述第一任务数据进行分子生成任务参考数据准备得到对应的第二参考数据向所述任务执行模块发送；并将所述任务执行模块发送的第一生成分子构象向所述外部接口反馈；所述第一生成分子构象为一个生成分子的三维分子构象；所述三维分子构象由对应的原子对象集和化学键对象集组成；所述原子对象集由一个或多个原子对象组成；每个所述原子对象包括原子索引、原子类型和原子坐标；所述化学键对象集由一个或多个化学键对象组成；每个所述化学键对象包括化学键索引、化学键类型和化学键原子索引组；所述化学键原子索引组由当前化学键对象对应的两个所述原子对象的所述原子索引组成；所述任务训练模块用于根据所述第一参考数据和所述复合物数据库对所述自回归模型库中的指定模型进行训练得到对应的所述第一训练状态向所述任务调度模块发送；所述任务执行模块用于根据所述第二参考数据和所述任务接口库进行分子生成任务执行处理得到对应的所述第一生成分子构象向所述任务调度模块发送；所述复合物数据库包括多个复合物数据集；每个所述复合物数据集对应一个数据集索引；每个所述复合物数据集由多个复合物记录组成；每个所述复合物记录对应一个蛋白质-配体复合物，该蛋白质-配体复合物由一个蛋白质口袋与一个配体分子结合而成；所述复合物记录包括复合物构象、蛋白质口袋构象和配体分子构象；所述复合物构象、所述蛋白质口袋构象和所述配体分子构象分别为当前记录对应的蛋白质-配体复合物、蛋白质口袋和配体分子的所述三维分子构象，所述蛋白质口袋构象和所述配体分子构象各为所述复合物构象的一个子构象；所述自回归模型库包括Pocket2Mol模型、GraphBP模型和FLAG模型；所述任务接口库包括五类分子生成任务接口，分别为配体生成任务接口、连接子生成任务接口、片段生长任务接口、侧链修饰任务接口和骨架跃迁任务接口。

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