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申请/专利权人：苏州道影医疗科技有限公司
摘要：本发明公开了一种整合空间多组学数据的肿瘤微环境分析方法，包括以下步骤：S1、使用神经网络模型对质谱流式成像技术获得的图像文件进行细胞分割；S2、对细胞分割数据进行预处理，包括去重、异常值处理、Min‑Max归一化，对数据进行降维、聚类、注释；S3、对IMC注释后数据不同组别间不同细胞类型频率统计检验，Region分析，Patch分析，肿瘤细胞邻域分析；S4、对单细胞转录组数据进行降维、聚类、注释；S5、使用注释后的单细胞数据作为参考集，对空间转录组数据进行解卷积，划分特定细胞类型阳性和阴性区域，查找差异基因。本发明，为深入理解肿瘤组织中的生物学过程提供了有力的工具和框架。
主权项：1.一种整合空间多组学数据的肿瘤微环境分析方法，其特征在于，包括以下步骤：S1、使用神经网络模型对质谱流式成像技术获得的图像文件进行细胞分割；S2、对细胞分割数据进行预处理，包括去重、异常值处理、Min-Max归一化，对数据进行降维、聚类、注释；S3、对IMC注释后数据不同组别间不同细胞类型频率统计检验，Region分析，Patch分析，肿瘤细胞邻域分析；S4、对单细胞转录组数据进行降维、聚类、注释；S5、使用注释后的单细胞数据作为参考集，对空间转录组数据进行解卷积，划分特定细胞类型阳性和阴性区域，查找差异基因；S6、使用差异基因进行TCGA生存分析，GO和KEGG富集分析，NicheNet受配体分析。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 苏州道影医疗科技有限公司 一种整合空间多组学数据的肿瘤微环境分析方法
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