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申请/专利权人:生命技术公司
摘要:公开了本发明的实施方案,这些实施方案提供了用于生成和评估关于来自qPCR测定的特定扩增曲线是否指示样本中靶分子的存在的自动化预测的改进的计算机系统、计算机化方法和计算机程序产品。在一些实施方案中,使用深度学习网络来生成预测。在一些实施方案中,生成曲线质量预测并将其用于评估是否可以从特定扩增曲线可靠地进行扩增预测或者该曲线是否反映qPCR测定中的异常。在各种实施方案中,还生成预测置信度数据并将其与预测数据一起用于电子用户界面中以改进qPCR测量。
主权项:1.一种对定量聚合酶链反应qPCR仪器的输出进行计算机化处理的方法,所述qPCR仪器被配置为生成扩增数据,在本文中被称为扩增曲线,扩增曲线包括与针对用于对生物样本进行qPCR测定的qPCR仪器的多个热循环获得的荧光测量结果相对应的数据,所述方法通过使用一个或多个计算机处理器执行包括以下的处理来实现:预处理由所述qPCR仪器生成的多个扩增曲线以针对所述多个扩增曲线中的扩增曲线获得工程化特征和经预处理的扩增曲线;由一个或多个扩增调用深度学习网络处理所述经预处理的扩增曲线和所述工程化特征中的一个或多个工程化特征以生成扩增调用数据;由一个或多个曲线质量调用深度学习网络处理所述经预处理的扩增曲线以生成曲线质量调用数据;以及使用所述扩增调用数据和所述曲线质量调用数据来提供被配置为便于所述qPCR仪器的所述输出的用户评估的交互式电子图形用户界面GUI。
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