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申请/专利权人：安徽元构生物科技有限公司
摘要：本发明提供一种噬菌体启动子的预测方法及装置，该方法包括：获取待预测基因组序列；基于各查询子序列分别和与各查询子序列间隔大于间隔阈值的各候选子序列进行匹配，得到候选子序列集；各查询子序列是从所述待预测基因组序列的开始位置开始，以步长为1获取预设长度的连续子序列得到的；筛选各查询子序列以及候选子序列集，以确定各候选组；基于各候选组中子序列的个数，确定待预测基因组序列的噬菌体启动子。本发明提供的方法，通过将待预测基因组序列的全基因组子序列进行匹配比对，筛选各查询子序列以及与各查询子序列相匹配的候选子序列集，实现了假阴性和假阳性“双低”的精准预测。不参考已鉴定的噬菌体启动子的基序，提升了预测的通用性。
主权项：1.一种噬菌体启动子的预测方法，其特征在于，包括：获取待预测基因组序列；基于各查询子序列分别和与所述各查询子序列间隔大于间隔阈值的各候选子序列进行匹配，得到与所述各查询子序列相匹配的候选子序列集；所述各查询子序列是从所述待预测基因组序列的开始位置开始，以步长为1获取预设长度的连续子序列得到的；所述各候选子序列与对应的所述各查询子序列的序列长度是相等的；筛选所述各查询子序列以及与所述各查询子序列相匹配的候选子序列集，确定所述待预测基因组序列的各候选组；基于所述各候选组中子序列的个数，确定所述待预测基因组序列的噬菌体启动子。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 安徽元构生物科技有限公司 噬菌体启动子的预测方法及装置
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