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石斑鱼肠孢虫的检测引物和探针及其应用 

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申请/专利权人:中国水产科学研究院黄海水产研究所

摘要:本发明属于微生物检测技术领域,具体涉及石斑鱼肠孢虫的检测引物和探针及其应用。本发明针对石斑鱼肠孢虫的SSUrRNA基因设计出引物及探针,建立了基于TaqMan‑MGB探针的实时荧光定量PCR和基于等温扩增技术的检测方法,该两种方法对目的基因的检测灵敏度分别为6.1和268拷贝反应,检测应用中还具有检测快速、特异和重复性好的优点。其中的等温扩增方法,可在恒温条件下20min内可完成检测并可目测判断结果,适用于病原的现场诊断和检测试剂盒开发。

主权项:1.一种石斑鱼肠孢虫的检测引物和探针,其特征在于:所述的引物和探针的核苷酸序列如下:(1)3套等温扩增引物的核苷酸序列:第一套引物组成及核苷酸序列:引物1:E.ep_F3_1:5’-AACACGATGATAAAAATCGTAGA-3’,引物2:E.ep_B3_1:5’-TGCTAGAATTACAGCGGTAT-3’,引物3:E.ep_FIP_1:5’-TCCAGGTAGAGTCTAGAGATTTCATTTTTTTTGCTAAATATTGCTAGCGG-3’,引物4:E.ep_BIP_1:5’-GAGGCGAAAGCGACGTTCTTTTTTCTAATCACTTTCAATACTCCAGC-3’,引物5:E.ep_LF_1:5’-CCTATACCACGTTCCCTATCCATT-3’,引物6:E.ep_LB_1:5’-AGACGTATCCGAGGGTCAAG-3’;第二套引物组成及核苷酸序列:引物1:E.ep_F3_2:5’-GGATAGTACAGCCGCAAG-3’,引物2:E.ep_B3_2:5’-TCCAACACTTAAGTTAAAGATCA-3’,引物3:E.ep_FIP_2:5’-CGTTGAGTTAAATTAAGCGGCATAATTTTACTGAAACTTAAACGATATTGGC-3’,引物4:E.ep_BIP_2:5’-GGAAAACTTACCAGGGTCAAGTTTTTTCATCAATTTACAACGGCCAT-3’,引物5:E.ep_LF_2:5’-TCCACTACTGGTGGTAAACTTCC-3’,引物6:E.ep_LB_2:5’-CATGAGATAAACGAGAGTGGTGC-3’;第三套引物组成及核苷酸序列:引物1:E.ep_F3_3:5’-ACGGTAACCTGTGGCTAA-3’,引物2:E.ep_B3_3:5’-CGTCTAATAAATGTCTCTTCTCAA-3’,引物3:E.ep_FIP_3:5’-CGTCACCCATTGTTGCCTTGTTTTGCGCAGTCCTATTATGTTTG-3’,引物4:E.ep_BIP_3:5’-AATCAGGGTTTGATTCCGGAGAGTTTTAAGTGGACAATTTTCGCG-3’,引物5:E.ep_LF_3:5’-GGAGTCCATTACACTACCAA-3’,引物6:E.ep_LB_3:5’-GGAGCCTGAGAGATGGC-3’;(2)荧光定量PCR检测引物及探针核苷酸序列:引物1:E.ep_F:5’-ACGTCCGTAGCTGTAGATGCAA-3’,引物2:E.ep_R:5’-CCTCTGTTGGTCCAGGTAGAGTC-3’,探针:E.ep_P:5’-CGTGGTATAGGTAGACAAAG-3’。

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权利要求:

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