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申请/专利权人：中国科学院亚热带农业生态研究所;岭南现代农业科学与技术广东省实验室;华智生物技术有限公司

摘要：本发明公开了一种湖南宁乡猪SNP分子标记及其应用。本发明的宁乡猪SNP分子标记包括100个SNP分子标记中的至少一种，所述100个SNP分子标记的基因组位置是基于猪的参考基因组Sscrofa11.1进行序列比对确定的，本发明的SNP分子标记可用于特异性鉴定湖南宁乡猪，将其用于制备液相芯片，得到的液相芯片可以实现宁乡猪高通量、低成本基因型分型，可应用于宁乡猪的品种鉴定、亲缘关系分析及宁乡猪资源保护、开发与利用，为宁乡猪分子育种应用提供重要技术支撑。

主权项：1.一种宁乡猪SNP分子标记，其特征在于，包括100个SNP分子标记中的至少一种，所述100个SNP分子标记的基因组位置是基于猪的参考基因组Sscrofa11.1进行序列比对确定的，位点信息具体如下： Chr:位置 REF ALT Chr:位置 REF ALT Chr:位置 REF ALT Chr:位置 REF ALT Chr:位置 REF ALT 1:30706789 C T 4:38401436 G A 9:137475357 C T 14:139326523 G C 18:9287272 C G 1:72541069 T A 4:123644085 A G 10:4402751 G C 14:139327798 A G 18:9290414 A C 1:72542429 A G 5:86943792 A T 10:16788826 G A 15:9621870 C A 18:10931753 C T 1:76383365 A G 5:99347300 T C 10:18472057 T A 15:9626920 C A 18:13403811 G A 1:122844306 G A 6:9894935 G A 11:26684913 G A 15:9628759 T G 18:13405978 A T 1:186134625 A G 6:43348722 A G 11:27379407 G A 15:9631178 T C 18:13460401 T C 1:186271754 T A 7:18288241 C G 12:57558776 G A 15:9636598 A G 18:13480882 C T 1:186933614 A G 7:68587814 C T 12:57708671 A G 16:26972901 A G 18:21687338 A G 1:186936319 G T 7:68592277 C T 13:78205772 C T 16:38459827 T C X:7511704 G A 1:186982603 G A 7:68594645 C T 13:78209462 G A 16:59833614 G A X:13395986 T C 1:187925668 C G 7:68595895 A G 13:78211987 G A 16:62080512 T C X:33615191 G A 1:187933055 C T 7:68601818 A G 13:78214556 T C 16:62081806 G C X:40353257 G A 1:254158445 G C 8:8923894 C T 13:78228057 G T 16:62084926 C A X:90199101 C G 2:6471699 G A 8:124675281 C T 13:78247487 T C 16:62137621 A G X:107152172 C A 2:18077280 C G 8:124680923 G A 13:139014120 T C 16:77082739 C T X:109312287 C T 2:130409393 C T 8:131013422 C T 13:203600129 A G 16:77086044 C T X:112707106 G C 3:2614068 C T 9:120440420 A G 14:1039774 A C 17:9465295 T C X:113074349 A T 3:5946336 G A 9:132377715 A G 14:55300523 G C 17:60184474 G A X:113464420 A C 3:5948431 T C 9:135200648 T G 14:99885890 G A 17:60187197 G A X:116407551 A G 4:9238856 G A 9:136737601 C G 14:139268186 G T 17:60202035 G A X:120020913 T G 。

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